山东大学冠心病分子分型和个体化诊疗生物芯片测试化验加工单一

第一篇：山东大学冠心病分子分型和个体化诊疗生物芯片测试化验加工单一

山东大学冠心病分子分型和个体化诊疗生物芯片测试化验加工单一

来源采购公告

山东大学拟参考采用单一来源方式采购冠心病分子分型和个体化诊疗生物芯片测试化验加工项目。

一、采购项目名称：冠心病分子分型和个体化诊疗生物芯片测试化验加工

二、公示内容：

2013－2015年我们做过“冠心病相关分子标志物筛选”科研服务类项目，通过对400例样品的研究，在SNP、甲基化、mRNA、miRNA、lncRNA多个层面进行分子标志物的筛选，其中在lncRNA层面找到了预测准确率达100%的biomarker。2016年采购的科研服务项目是对于一期筛选后的二期验证，对100个临床样本进行检测后，验证了一期筛选biomarker的准确性，并发现冠心病发作具有南北方区域差异性。近期我们委托华西医院收取了80例具有代表性的华南地区冠心病患者病例样本和对照实验样本，本次采购的科研服务项目实验是对二期验证结果的有效补充。采用了博奥自主研发的晶芯®lncRNA v2.0基因芯片，此芯片属于博奥生物具有自主知识产权的研究类芯片，筛选和验证所用到的芯片必须是同一款芯片，才能确保验证的结果是稳定可靠的，发表文章或申请专利时才不会被质疑实验的准确性。如果更换其他公司或其他同类型检测产品，则验证实验的准确性无法保证，属于不规范的实验设计，无法得到更有力的验证数据，故申请单一来源采购。

具体指标参数参考附件，实际以采购文件为准。

三、本项目预算：63万元

四、拟定唯一供应商名称：北京博奥晶典生物技术有限公司

五、资格要求：

遵守《中华人民共和国招标投标法》、《中华人民共和国政府采购法》等有关的国家法律、法规和条例，具备本文件中规定的条件：

1)具有独立承担民事责任的能力；

2)具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度； 3)具有履行合同所必需的设备和专业技术能力； 4)有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录；

5)参加政府采购活动前三年内，在经营活动中没有重大违法记录； 6）具备法律、行政法规规定的其他条件。

六、报名需提供的资料：

1、企业法人营业执照副本；税务登记证（三证合一除外）、组织机构代码证（三证合一除外）；

2、法人授权委托书及授权代表身份证。

3、近二年（指2015年、2016年）的年度财务报表（至少包含资产负债表、利润表）。

4、近三个月依法缴纳税收的证明和近三个月依法缴纳社保的证明。

七、公告时间：

自本公告发布之日起五个工作日内。

八、联系方式 采购人：山东大学

地址：济南市山大南路27号 联系人：王希文 联系方式：0531-88363689 邮箱：cggl@sdu.edu.cn

二〇一七年十一月九日

山东大学招标采购管理中心

技术参数

此次测试化验加工涉及的指标共分为2个：mRNA和lncRNA差异表达、lncRNA功能实验 1.1样品数量：共计160份样品

2.1检测指标：通过合理安排实验，结合前期大样本筛选结果，对挑选出的差异mRNA和lncRNA进行进一步验证，准确检测新增加的160份样品中两种指标（mRNA和lncRNA）的表达差异变化，找出冠心病发病南北方区域差异性biomarker，并完成lncRNA功能实验； 3.1实验方法：芯片（验证阶段的芯片必须与筛选阶段使用的芯片类型相同）和RNA pull-down的检测方法； 3.2指标检测需求：

3.2.1 mRNA：验证阶段芯片探针数量覆盖至少34000条；* 3.2.2 lncRNA：验证阶段使用的lncRNA芯片探针数量覆盖至少39000条，验证阶段使用的芯片必须与筛选阶段使用的芯片类型相同。合理安排实验设计，结合筛选阶段的芯片实验及预测结果，对另外160个样品进行芯片实验验证，找出预测准确率90%以上的表征冠心病发病南北方区域差异性lncRNA biomarker；*

3.2.3 lncRNA功能实验：完成预测准确率90%以上的表征冠心病发病南北方区域差异性的2个lncRNA的功能实验，包括RACE全长扩增、RNA pull-down、ChIRP、ChIP等lncRNA功能验证所必须的实验。* 4.1数据分析需求：

4.1.1 提供合理的解决方案，有详细的实验方法、完整的实验流程，公司要有丰富的项目经验，能够满足我们提出的各项要求；对于lncRNA的biomarker预测，需采用至少三种以上的分析方法进行准确预测；

4.1.2 找出南方病例组与北方病例组之间mRNA和lncRNA指标存在的差异变化；

4.1.3 对lncRNA做靶基因预测，需采用数据库和物理位置进行预测，并结合mRNA共表达信息，能筛选到可能性较大的靶基因100个以内；

4.1.4 对分析得到的能够表征冠心病发病南北方区域差异性的2个lncRNA 进行RNA pull-down功能实验；

4.1.5 对于lncRNA的研究领域，公司要有丰富的项目经验，SCI收录文章数量不少于20篇； 4.1.6对于新型分子lncRNA，做biomarker分析，该部分为重点部分，必须要有支持发表的lncRNA biomarker的文章，最好有支持发表的高水平文献（IF>10），必须有完整的实验设计以及数据分析方案。* 4.1.6对于预测出来的lncRNA biomarker后续功能实验，公司项目经验必须丰富，必须有完整的实验设计方案和支持发表的文章。*