第一篇：莱芜市卫生局关于进一步加强新型农村合作医疗的管理工作通知
莱芜市卫生局文件
莱卫医字〔2009〕41号
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莱芜市卫生局
关于进一步加强新型农村合作医疗管理
工作的通知
各区卫生局，高新区、雪野旅游区社会事务管理局，泰钢工业园，各定点医疗单位：
为强化各级新农合管理机构的责任，加强对定点医疗机构的监督管理，确保新农合基金安全运行，根据省卫生厅有关新农合的指导意见及市政府办公室《新型农村合作医疗市级统筹试点工作实施方案》（莱政办发〔2009〕3号），《2009年新型农村合作医疗统一补偿方案》（莱政办发〔2009〕5号），就新农合管理工作作如下规定，望认真贯彻执行。
一、基金管理
（一）管理模式。从2009年起，全市统一实行住院统筹加门诊统筹模式。新农合基金分为一般统筹基金和风险基
2公室报告，新农合管理办公室通过网络管理系统实施动态监管，没有及时传报的报销费用由定点医疗机构承担。特殊情况可先就医、办理住院手续，但入院后需在2个工作日内持《合作医疗证》到定点医院合管办、住院处补办登记手续。
3.定点医疗机构要做到新农合管理制度上墙，在醒目位置明确参合农民就诊流程，悬挂新农合宣传标语，在诊室桌面放置“请出示合作医疗证”牌等，营造良好的新农合宣传氛围。
4.定点医疗机构要指定一名领导分管新农合工作，成立新农合管理科（处、室），做好定点医疗服务管理工作。定点医疗机构要做好对医护人员的培训，培训内容包括新农合有关政策、要求、补偿比例和程序、医护人员职责及应注意事项等，使定点医疗机构的医务人员及相关人员掌握新农合业务知识和相关政策，提高业务水平，适应开展新农合工作的需要。
（三）转诊转院。
1.取消市内转诊转院审批制度，参合农民在市内定点医疗机构就诊不须办理转诊转院审批手续。跨区就诊的，须向户口所在区合管办报告。
2.严格市外转院审批。参合农民到本市以外的定点医疗机构住院治疗，须提供市内二级以上定点医院门诊病历或经治医师提出转院意见，并填写“莱芜市新农合转诊转院审批表”，由医院医务科或门诊部盖章，在5个工作日内持《合作医疗证》、本人有效身份证明以及医院诊断证明等材料到区合管办办理转诊转院手续。否则按擅自转院处理。参合农民因急诊、外出务工在市外新农合定点医疗机构就诊的可先就医，后补办有关手续。
3.参合农民市外就医后，凭定点医疗机构出具的出院结算证明、住院病历首页、费用清单、医院住院收费发票及新农合管理机构转院审批表等材料，回户口所在地乡镇合管办办理补偿手续。外伤、中毒病人还要提供住院病历复印件。
4.参合农民在市外非定点医疗机构就医的费用不得纳入新农合基金补偿。
（四）费用控制。
1.定点医疗机构要加强医务人员医德医风建设，正确处理社会效益和经济效益的关系，提高医疗技术水平和服务质量。严格执行新农合有关规定，在诊疗过程中因病施治、合理用药、合理检查、合理收费，为参合农民提供价格合理、便捷的医疗卫生服务。
2.定点医疗机构必须严格执行《山东省新型农村合作医疗基本药物目录》（2009版）。目录外费用占总费用的比例在村和一、二、三级定点医疗机构应分别不高于5%、10%、15%和20%，并将其作为对定点医疗机构考评的重要指标。
3.定点医疗机构对参合农民进行治疗，特殊情况必须使用非《新型农村合作医疗基本药物目录》药品时，要征求患者或其家属的意见并签字，同时在处方上注明“自费”字样。
6销费用的，将本医疗机构以外发生的费用记入本医疗机构住院总费用的，不严格执行领款人签字制度的等，所发生的不合理补偿费用由定点医疗机构承担，于拨付定点医疗机构补偿费用时扣除。定点医疗机构发生以上违规行为，视情节轻重给予警告、通报批评、限期整改，整改仍不合格的，取消定点医疗机构资格。
3.各级新农合管理经办机构在督查过程中，发现定点医疗机构违规违纪行为，要依照规定处理并将检查结果（现场检查笔录）和拟处理意见书面上报市合管办。瞒报或不处理的一经发现将逐级追究有关单位和责任人的责任。
4.对定点医疗机构严重违反新农合政策规定，出现套取新农合基金情况的，对定点医疗机构进行处罚的同时，按照管理权限将追究相关管理经办机构的连带责任。
5.严肃查处违法违规行为，对严重违反新型农村合作医疗管理规定的除取消其定点资格外，并按照《关于违反新型农村合作医疗制度行政处分规定（试行）》（鲁政办发〔2005〕96号）等有关规定追究相关人员的责任。
四、结算办法
严格规范基金拨付程序，全市新农合定点医疗机构统一实行微机联网、网上审核、即时报销。定点医疗机构要设立专门的新农合结报窗口，参合农民在市级和本区定点医疗机构在规定范围内门诊就诊或住院治疗出院时，先由定点医疗机构垫付其应补偿费用。各区合管办按月审核汇总各定点医疗机构、乡镇合管办报销支付的医疗费用，填写“新型农村合作医疗基金支出汇总表（支款凭证）送交市卫生局合管办审核，报市财政局申请应补偿资金，财政部门审核无误后，及时拨付给定点医疗机构或乡镇合管办。
五、年检与考评
实行住院平均医药费用通报和警示告诫制度，并以适当的方式定期公示定点医疗机构医药费用情况，对超过平均医药费用的定点医疗机构及时给予书面告诫，对多次或一次严重超过平均医药费用的定点医疗机构进行专项检查并予以纠正。定点医疗机构实行年检制度，由卫生行政部门组织对定点医疗机构进行综合考评，对连续两年考评合格的，可实行两年一考评制度。对考核不合格或不按时接受考核的定点医疗机构，取消定点医疗机构资格并向社会公示。
二〇〇九年五月二十二日
第二篇：莱芜市卫生局关于进一步加强新型农村合作医疗管理工作的通知
莱芜市卫生局文件
莱卫医字〔2009〕41号
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莱芜市卫生局
关于进一步加强新型农村合作医疗管理
工作的通知
各区卫生局，高新区、雪野旅游区社会事务管理局，泰钢工业园，各定点医疗单位：
为强化各级新农合管理机构的责任，加强对定点医疗机构的监督管理，确保新农合基金安全运行，根据省卫生厅有关新农合的指导意见及市政府办公室《新型农村合作医疗市级统筹试点工作实施方案》（莱政办发〔2009〕3号），《2009年新型农村合作医疗统一补偿方案》（莱政办发〔2009〕5号），就新农合管理工作作如下规定，望认真贯彻执行。
一、基金管理
（一）管理模式。从2009年起，全市统一实行住院统筹加门诊统筹模式。新农合基金分为一般统筹基金和风险基金，一般统筹基金包括住院统筹基金、门诊统筹基金和其他
2管，没有及时传报的报销费用由定点医疗机构承担。特殊情况可先就医、办理住院手续，但入院后需在2个工作日内持《合作医疗证》到定点医院合管办、住院处补办登记手续。
3.定点医疗机构要做到新农合管理制度上墙，在醒目位置明确参合农民就诊流程，悬挂新农合宣传标语，在诊室桌面放置“请出示合作医疗证”牌等，营造良好的新农合宣传氛围。
4.定点医疗机构要指定一名领导分管新农合工作，成立新农合管理科（处、室），做好定点医疗服务管理工作。定点医疗机构要做好对医护人员的培训，培训内容包括新农合有关政策、要求、补偿比例和程序、医护人员职责及应注意事项等，使定点医疗机构的医务人员及相关人员掌握新农合业务知识和相关政策，提高业务水平，适应开展新农合工作的需要。
（三）转诊转院。
1.取消市内转诊转院审批制度，参合农民在市内定点医疗机构就诊不须办理转诊转院审批手续。跨区就诊的，须向户口所在区合管办报告。
2.严格市外转院审批。参合农民到本市以外的定点医疗机构住院治疗，须提供市内二级以上定点医院门诊病历或经治医师提出转院意见，并填写“莱芜市新农合转诊转院审批表”，由医院医务科或门诊部盖章，在5个工作日内持《合作医疗证》、本人有效身份证明以及医院诊断证明等材料到区合管办办理转诊转院手续。否则按擅自转院处理。参合农民因急诊、外出务工在市外新农合定点医疗机构就诊的可先就医，后补办有关手续。
3.参合农民市外就医后，凭定点医疗机构出具的出院结算证明、住院病历首页、费用清单、医院住院收费发票及新农合管理机构转院审批表等材料，回户口所在地乡镇合管办办理补偿手续。外伤、中毒病人还要提供住院病历复印件。
4.参合农民在市外非定点医疗机构就医的费用不得纳入新农合基金补偿。
（四）费用控制。
1.定点医疗机构要加强医务人员医德医风建设，正确处理社会效益和经济效益的关系，提高医疗技术水平和服务质量。严格执行新农合有关规定，在诊疗过程中因病施治、合理用药、合理检查、合理收费，为参合农民提供价格合理、便捷的医疗卫生服务。
2.定点医疗机构必须严格执行《山东省新型农村合作医疗基本药物目录》（2009版）。目录外费用占总费用的比例在村和一、二、三级定点医疗机构应分别不高于5%、10%、15%和20%，并将其作为对定点医疗机构考评的重要指标。
3.定点医疗机构对参合农民进行治疗，特殊情况必须使用非《新型农村合作医疗基本药物目录》药品时，要征求患者或其家属的意见并签字，同时在处方上注明“自费”字样。
4.定点医疗机构为患者检查和治疗时，不得将自费药品
6院总费用的，不严格执行领款人签字制度的等，所发生的不合理补偿费用由定点医疗机构承担，于拨付定点医疗机构补偿费用时扣除。定点医疗机构发生以上违规行为，视情节轻重给予警告、通报批评、限期整改，整改仍不合格的，取消定点医疗机构资格。
3.各级新农合管理经办机构在督查过程中，发现定点医疗机构违规违纪行为，要依照规定处理并将检查结果（现场检查笔录）和拟处理意见书面上报市合管办。瞒报或不处理的一经发现将逐级追究有关单位和责任人的责任。
4.对定点医疗机构严重违反新农合政策规定，出现套取新农合基金情况的，对定点医疗机构进行处罚的同时，按照管理权限将追究相关管理经办机构的连带责任。
5.严肃查处违法违规行为，对严重违反新型农村合作医疗管理规定的除取消其定点资格外，并按照《关于违反新型农村合作医疗制度行政处分规定（试行）》（鲁政办发〔2005〕96号）等有关规定追究相关人员的责任。
四、结算办法
严格规范基金拨付程序，全市新农合定点医疗机构统一实行微机联网、网上审核、即时报销。定点医疗机构要设立专门的新农合结报窗口，参合农民在市级和本区定点医疗机构在规定范围内门诊就诊或住院治疗出院时，先由定点医疗机构垫付其应补偿费用。各区合管办按月审核汇总各定点医疗机构、乡镇合管办报销支付的医疗费用，填写“新型农村合作医疗基金支出汇总表（支款凭证）送交市卫生局合管办审核，报市财政局申请应补偿资金，财政部门审核无误后，及时拨付给定点医疗机构或乡镇合管办。
五、年检与考评
实行住院平均医药费用通报和警示告诫制度，并以适当的方式定期公示定点医疗机构医药费用情况，对超过平均医药费用的定点医疗机构及时给予书面告诫，对多次或一次严重超过平均医药费用的定点医疗机构进行专项检查并予以纠正。定点医疗机构实行年检制度，由卫生行政部门组织对定点医疗机构进行综合考评，对连续两年考评合格的，可实行两年一考评制度。对考核不合格或不按时接受考核的定点医疗机构，取消定点医疗机构资格并向社会公示。
二〇〇九年五月二十二日
第三篇：新型农村合作医疗需要进一步完善
新型农村合作医疗需要进一步完善
朱新峰
农村新型合作医疗因其能够解决一些群众看病难的问题，特别是一些农村大病患者，能够从新型合作医疗当中获得一大笔补偿，在全国农村试点推广以来，受到农村广大群众的欢迎，也为进一步健全完善农村社区医保制度提供了必不可少的实践经验。但是，在一些地方，新型农村合作医疗实践过程当中依然存在一些问题，值得高度重视。
一是乡（镇）卫生院服务能力有待进一步提高，县、乡（镇）医疗卫生技术骨干短缺，乡（镇）卫生院医疗科室开设不全，虽然国家投资配备了一定的医疗器械，并且逐年增加，但是，乡村基本的医疗设备还是相对滞后，医生医疗水平依然低下，群众信任程度较低，一定程度上影响了新型农牧区合作医疗工作。
二是新型农村合作医疗并没有彻底解决农村大病问题。农村影响社会稳定发展的大病医疗问题，由于报销数额有限，或者上有封顶，农民得大病后报销医药费有限，虽然比没有实行新型合作医疗要好一些，但是，农村大病患者及其家庭依然难以承受大病巨额医疗费，没钱看病现象依然存在，大病致贫导致全家人贫穷现象依然存在。最为关键的还在于，虽然有合作医疗报销，但是，药价昂贵，医院管理不善等问题依然存在，特别是一些大病患者家庭，依然存在有病难治在家等死的现象。而且，一些动辄高额的医疗费，依然出现一人得病全家贫困的现象。新型合作医疗这种形式，仅仅是缓解了部分农村看病难问题，但是，依然并没有完全解决农村大病问题，对于农村大病带来的诸多社会问题依然是解决乏术，无能为力，从某种角度上讲，目前的新型农村合作医疗制度依然是保小病不保大病，没有彻底解决农村群众迫切需要解决的大病医疗问题。同时，群众对于新型合作医疗繁琐的报销手续也有意见，一些偏远地区的农民甚至来回多次的车票比报销票据还要多，无形中影响了新型农村合作医疗的推广实践。新型合作医疗仅仅是解决了部分农村不大不小病人员的问题，而并没有真正解决大病医疗问题。
三是目前乡（镇）事业单位机构改革，开始定编定岗，乡（镇）合管办（合作医疗管理办公室）没有核定编制，工作人员均为乡镇各站所临时抽调人员，不在自己核定的编制岗位上，时间长了担心出现空挂现象，长此以往，这中在编不在岗现象势必影响合作医疗管理队伍的稳定性和工作质量。
四是具体工作过程中，存在一些问题。如定点医院不合理。定点医疗机构太少，特别是一些专科医院，群众信任的医院因为某种利益原因未纳入定点范围，影响参合农牧民就诊。比如基本药品目录范围太窄，目前虽然看起来补偿比例很高，但在核算过程中由于受《三个目录》限制，住院补偿比很低。又如，由于农牧民居住极为分散，报销手续严格繁琐，且门槛费依然较高，给部分群众看病带来一定的困难。一些村卫生室没用安装软件系统，门诊费用不能及时录入计算机，导致医疗证上家庭账户资金与计算机上余额对不上，影响定点医疗机构网上结算等。另外，随着一些地方农民视为“救命钱”的大病基金已经被一些乡镇卫生院医务人员利用职务之便盯上，通过延长病人住院时间、门诊改为住院治疗、伪造病人住院资料等手段侵吞“新农合”基金，并有扩大的趋势。
随着国家投入力度加大，国家每年给农村新型合作医疗每个人投入资金额不断加大翻番，为新型合作医疗发展提供了部分资金保障。进一步完善新型农村合作医疗制度势在必行。首先，新型农村合作医疗是一种公益事业，我们有必要，也有义务让全国老百姓享受到改革的巨大利益。将有效解决群众看病难、看病贵问题当作一项大事来高度重视，彻底解决一人大病全家贫困现象的产生，杜绝有病没钱治在家等死现象的发生。对于一些大病患者的家庭，进行必要的保险补助势在必行。
其次，加大医疗体制改革力度。目前看病难看病贵与医疗体制改革滞后有直接的关系。
许多药品定价奇高，医生收入直接与药品销售和检查挂钩，导致医生给别人看病拿提成现象增多，不当牟取暴利，这些现象，都需要在进一步医疗体制改革的过程中加以完善，防止医疗体制改革滞后，个别利益集团牟取暴利导致诸多社会问题的发生。
第三，加大业务人员的培训力度。快捷的方式便是从现有的大中专医科毕业生中挑选一批下派到乡村医院工作实践。鉴于乡村级医疗点人员业务水平急需提高更新的现状，各级政府及卫生行政部门必须加大对农村卫生人才培养力度，采用长期培训与短期培训相结合，脱产培训与函授学习相结合的办法，对医务人员进行排队、分期、分批安排培训，提高乡村医生的学历层次，使卫生技术人员的业务水平普遍提高，真正做到小病不出村，常见病不出乡，大病不出县，使农牧民群众有病能就近得到及时有效的治疗，既能减轻农牧民长期外出看病带来的不便和经济负担，又能充分利用农村卫生资源，确保有限的合作医疗基金能够给群众提供更多的服务。特别是一些边远贫困地区，国家有必要加大扶植力度，给予那些到这些地方工作的医科毕业生以更加优惠的条件和待遇，摒弃一些不利于医务人员引进的诸如“民族”、“年龄”等歧视性条件，真正将那些合格的医务人员充实到基层第一线，真正解决基层群众看病难的问题。
第四，进一步加大合作医疗制度的健全与完善，提高医疗水平，更新医疗器械，改善服务态度，完善群众申诉渠道，巩固服务质量，因地制宜地解决群众提出的问题。特别是完善群众申诉渠道问题，应该得到有关部门的重视。新型农村合作医疗能否办下去，关键在于能否公开公正，在于充分听取群众意见，在于建立便捷的与群众沟通和群众便捷反映诉求的平台渠道，解决的办法就是利用网络建立平台。有关信息及时上网公布对于确保群众监督是一种必不可少的形式。
第五，加大农村基层医疗机构的正常投入。许多农村乡镇医院之所与出现一些问题，关键在于我们对于这些基层投资过低，难以保障其正常运转，解决农村基层医疗保证问题，首先就要向农村基层医疗机构进行必要的投入，确保其能够维持基本的生存需要，保障农村社区基本医疗需要。
第六，充分相信群众。新农合要想健康发展，好事办实，就必须充分相信群众，要加大民主监督力度，加大新农合公开力度，将所有的权利运行全部置于群众监督的阳光之下，确保新农合健康发展，为新农村建设提供健康保障。
作者单位：新疆青河县人大科工委
第四篇：为进一步贯彻落实新型农村合作医疗政策
为进一步贯彻落实新型农村合作医疗政策，加强新农合资金管理，提高资金使用效益。根据省财政厅，卫生厅印发的《安徽省新型农村合作医疗专项资金绩效考评暂行办法》（财社〔2012〕》1093号）文件要求，市财政局、卫生局高度重视此项工作，成立绩效考评领导小组，及时召开工作会议，安排专业人员开展自查。
本次新农合资金绩效考评内容项目管理绩效、资金管理绩效和项目效益绩效3类7项33小项。考评自查组按照项目要求，认真查阅资料，开展问卷调查，走访入户调查和资料收集、整理、统计等工作。自查组对照考评内容和指标，自评出绩效分值，撰写自评报告，报省财政厅，卫生厅备案，圆满的完成2011新农合专项资金绩效考评自查工作。
第五篇：新型农村合作医疗
“新型农村合作医疗”
“新型农村合作医疗”背景：
合作医疗是由我国农民自己创造的互助共济的医疗保障制度，在保障农民获得基本卫生服务、缓解农民因病致贫和因病返贫方面发挥了重要的作用。它为世界各国，特别是发展中国家所普遍存在的问题提供了一个范本，不仅在国内受到农民群众的欢迎，而且在国际上得到好评。在1974年5月的第27届世界卫生大会上，第三世界国家普遍表示热情关注和极大兴趣。联合国妇女儿童基金会在1980～1981年年报中指出，中国的“赤脚医生”制度在落后的农村地区提供了初级护理，为不发达国家提高医疗卫生水平提供了样本。世界银行和世界卫生组织把我国农村的合作医疗称为“发展中国家解决卫生经费的唯一典范”。
合作医疗在将近50年的发展历程中，先后经历了20世纪40年代的萌芽阶段、50年代的初创阶段、60～70年代的发展与鼎盛阶段、80年代的解体阶段和90年代以来的恢复和发展阶段。面对传统合作医疗中遇到的问题，卫生部组织专家与地方卫生机构进行了一系列的专题研究，为建立新型农村合作医疗打下了坚实的理论基础。
随着我国经济与社会的不断发展，越来越多的人开始认识到，“三农”问题是关系党和国家全局性的根本问题。而不解决好农民的医疗保障问题，就无法实现全面建设小康社会的目际，也谈不上现代化社会的完全建立。大量的理论研究和实践经验也已表明，在农村建立新型合作医疗制度势在必行。2002年10月，《中共中央、国务院关于进一步加强农村卫生工作的决定》明确指出：要“逐步建立以大病统筹为主的新型农村合作医疗制度”，“到2010年，新型农村合作医疗制度要基本覆盖农村居民”，“从2003年起，中央财政对中西部地区除市区以外的参加新型合作医疗的农民每年按人均10元安排合作医疗补助资金，地方财政对参加新型合作医疗的农民补助每年不低于人均10元”，“农民为参加合作医疗、抵御疾病风险而履行缴费义务不能视为增加农民负担”。
“推进新型农村合作医疗”面临的问题：
一、以“大病统筹”为主的模式难以从根本上解决农民医疗问题。新型农村合作医疗以“自愿参保”为原则。虽然人均10元的缴费标准不会给农民带来太大的经济负担，但是健康的青壮年人群患大病风险较小，参与积极性较低，风险较大的高危人群则倾向于参加，这样逆向选择极容易导致农村合作医疗基金入不敷出。在政府投入能力有限的情况下，提高缴费标准将是维持新农合基金运转的唯一选择，但是费率的提高必定使农民的参合率下降，导致新农合基金最终崩溃。同时，“只报销大病”容易诱发农民将“小病当成大病医”的道德风险，造成医疗支出的急速上升。此外，和大病相比，对农民健康威胁更为普遍的是常见病和多发病，1998年全国卫生服务总调查表明，农村约有37.7%的病人发病后并未及时就医,很多农民的大病都是由于耽误对小病的治疗而形成的。只负责大病统筹而疏于对小病的防治和保健工作，必定不能从根本上改善农民的医疗保障状况。
二、相同的人均缴费标准对于不同收入水平的农民有失公平。在新农合开展初期，制定统一的缴费标准是操作起来最简便的方法，但是在我国广大的农村地区，农民之间收入差距较大。收入较高的农户往往愿意参合，因为在大多数地区，只需缴纳10元就可获得部分“大病”医疗保障，回报率较高。而对于很多人均纯收入不足百元的贫困农民群体，10元参合费仍是一笔不小的开支，而且缴纳后不能马上见到实效，因而参与积极性较低。结果就是——富裕的农民获得了农村合作医疗的好处，而贫困的农民仍然没有得到任何保障，这显然违背了建立新型农村合作医疗防止农民“因病致贫、因病返贫”的初衷。
三、农民自愿参合的积极性不高。农民自愿参与是新型农村合作医疗顺利推行的基础和根本保证。虽然统计数据显示试点地区农民的参合率大都达到70%以上，但是这些试点一般都
是经济发展相对较好地区，农民的支付能力较强，而且当地政府为了产生示范带动效应，加强了宣传投入力度，有些地方为了高参合率甚至出现在强制参合的现象。然而现实情况是在经济欠发达地区，农民对参加新农合的积极性普遍较差。以欠发达的江西赣州为例，调查结果显示50%的参合农户是在干部到家中说服后才交的，20%的农户只是盲目地“别人交，我也交”。在已参合的农户中，70%的人不了解参合知识，绝大多数农户对农村合作医疗的目的和意义一知半解，普遍对缴纳的10元参加的新农合抱有较高期望值，希望能马上得到回报，然而现实状况（大病统筹）又使农户积极性受挫，参合率自然不高。
四、农村合作医疗筹资效率低下，成本过高。由于农民对新农合了解甚少，自愿参保积极性很低，为了保证较高的参合率，很多工作人员不得不挨家挨户进行宣传、说服工作，大部分的参合额都是工作人员一个一个谈出来的。再加上农村地区农民居住非常分散，交通不便，更增加了筹资成本。另外，工作人员办事效率低下也是导致高筹资成本的重要原因。赣州市的调查显示，只有30%的工作人员主动学习合作医疗知识，大部分工作人员都是按部就班地进行宣传讲解工作，办事效率自然就低。据了解，60%的农民对工作人员的工作作风不满意，进一步挫败了农民的参合积极性。
五、农村合作医疗基金管理水平有待提高。现行的新农合基金管理模式主要有独立管理模式、银行（信用社）管理模式和保险公司参与模式三种。大部分试点地区采取的是“小而全”的独立管理模式，即各地区建立一套完整独立的、自上而下的管理系统，并配合一整套软、硬件措施。这样做虽然相对简单，但是它造成了条块分割、自成体系、相互不能兼容的局面，成为各级地方财政的沉重包袱。尤其是在经济欠发达的中西部地区，这种浪费的负面影响是相当大的。部分地区采用了在银行（信用社）设置基金帐户，做到专户储存、专帐管理、专款专用。虽然这样充分利用了银行庞大的业务网络，在收入和支出两个环节降低了管理成本，但是银行（信用社）的介入只是部分的，介入层次也很低，并不能真正提高新农合基金的管理和使用效率。少部分地区在新农合基金的管理中引入了保险公司。虽然保险业参与有利于控制新农合的运行风险，有利于节约政府成本，但是保险公司面临的最大问题就是对医疗机构的管控力度偏弱，对医疗费用上涨的控制还不够，而且引入保险公司又增加了保险公司与政府有关部门、医疗机构和参合农户的协调难度。
六、农村医疗救助制度和农村合作医疗制度未有机地结合。医疗救助制度是由政府统筹协调，民政部门组织实施，卫生、财政部门配合，对患大病农村五保户和贫困农民家庭的医疗费用按一定标准给予适当补助，以缓解其因病致病的一种制度。虽然医疗救助和新农合都是为了共同解决农民看病就医问题，但二者各有一套独立的筹资渠道、主管部门和工作对象。医疗救助资金主要来源于中央和地方预算、福利彩票的销售和社会捐助等，新农合资金则是由中央、地方和农户个人各负担1/3。医疗救助制度的运行依靠各地民政部门建立的管理机构，而新农合工作的开展则依赖于政府指导建立的单独的组织协调机构和经办、监管机构。总之，医疗救助和新农合在农村地区是完全割裂运行的，二者在机构设立、人员配备上存在大量的重叠，导致财政支出的巨大浪费。
七、农村基层医疗机构服务水平低。在全国大部分省市基本上都实现了乡镇有卫生院，村村有卫生室，但是由于医疗设备条件差，医务人员素质低，并不能满足参合农民的医疗需求。以安徽省16个“新农合”试点县为例，尽管在乡镇卫生院就医可比乡外就医多报销20%的医疗费用，但由于乡镇卫生院服务水平太低，60%的农户不得不选择在费用更高的县及县以上的大医院就医。更为严重的是，很多农村基层医疗机构限入了“缺人才——发展缓慢——经营困难——更缺人才”的恶性循环。据四川省卫生厅统计，四川全省乡镇卫生院中无专业学历的医务人员占40%，本科、专科学历的人员仅占9.8%，乡村医生中大专学历为1%，无专业学历的为72.5%，农村医疗人才匮乏已成为阻碍“新农合”长期安全运行的重要隐患。
八、农村医疗机构服务监管不完善。目前，新农合医疗费用报销基本上限于公立卫生系统，并选择定点医疗单位时也没有引入竞争机构，这就保护了落后的公立卫生机构，不利于医疗机构工作效率的提高。而且有调查显示，很多医院被新农合选为定点医疗单位后，次均住院费和门诊费用上涨较快，不合理用药、不合理检查问题比较突出，农民从报销中得到的实惠被不断上升的医疗费用抵销了，在一些地区，甚至出现了医患双方共同欺骗新农合组织，骗取医疗补助的现象。
“推进新型农村合作医疗”的对策：
一、加强农民的思想宣传工作。通过提高政府工作人员的素质和办事效率，转变粗放型的宣传工作，让广大农民意识到这种制度既不是政府的一项恩惠，也不是农民的一项负担，而是在政府的帮助、主导下的一项农民互助共济保障制度。
二、改善农村医疗机构的服务水平。加强对农村基层卫生技术人员的培训，提高农村医疗人员的专业知识和技能，同时加大对农村医疗机构的投入力度，引进先进设备，改善医疗环境，从硬件设施上保障合作医疗制度的完善。
三、探索建立稳定的合作医疗筹资机制。要在农民自愿基础上，探索建立形式多样、简便易行的农民个人筹资方式；同时进一步完善财政补助资金的拨付机制，规范和完善中央财政和地方财政的资金拨付管理办法；有条件的地区可以根据自身财力和农民收入增长情况，相应提高筹资标准，探索建立稳定可靠、合理增长的筹资机制，进一步提高了医疗保障水平。
四、形成科学规范的合作医疗统筹补偿方案。统筹补偿方案是新农合制度的核心，目前要在保证基金安全的前提下，想方设法逐步扩大参合农民受益面，提高参合农民受益水平。试点中，许多地方采取了住院统筹加家庭账户的统筹补偿方案。有些地方增加了健康体检，门诊大额补偿，慢性病、地方病和住院分娩补偿等，扩大了受益面；有些地方利用医疗救助和基金结余进行二次补偿，提高了受益水平。还有许多地方探索住院统筹加门诊统筹，从机制上探索进一步扩大受益面和提高受益水平。起付线、封顶线和补偿比例也直接关系到受益面和受益水平，各地也根据实际情况不断做出一些调整。统筹补偿方案要与基金的规模相适应，提高受益面和受益水平不能超出基金的承受能力，也不能因为盲目担心基金透支，未经科学测算，人为地缩小受益面，降低受益水平。要科学研究、合理确定基金的结余比例，提高基金使用效率，既要避免结余过多，也要切实防止基金透支，在此基础上调整统筹补偿方案，逐步扩大受益面，提高受益水平。
五、加强合作医疗基金运行管理和经办能力建设。随着新农合的全面推进，基金规模越来越大，监管任务越来越重，财政部、卫生部要研究制订财务会计制度，各地区要不断规范基金监管措施，健全基金管理制度，形成有效的监管机制。审核报付作为基金运行中的重要环节，要不断予以改进，切实做到方便参合农民。采取参合农民就医时先付费后到新农合经办机构报销的地方，要积极创造条件，尽可能采取参合农民就医时由医疗机构垫付费用，医疗机构定期到新农合经办机构兑付的办法。这种办法既方便参合农民，也便于对医疗机构的监管，还有利于精简经办机构的人员。同时，要积极推行计算机网络即时审核报付办法，提高审核报付工作的效率和质量。
六、加强对医疗服务和医药费用的监管。加强农村医疗机构的内部管理，建立健全疾病检查、治疗、用药等方面的规章制度及行之有效的自律机制。有效开展农村医疗机构及其服务行为的外部监管，建立定点医疗机构准入和退出机制，实行动态管理；根据基本诊疗和药品目录以及收费项目和价格，严格监管医疗机构服务行为；采取单病种定额付费、按人头预付、医药费用清单制、加强结算审核和补偿报销情况公示等，有效监管收费行为，切实控制医药费用。对违规行为，要严肃处理，决不姑息。同时，要进一步规范农村药品零售价格和进药渠道。
七、整合相关资源，大力推进新型农村合作医疗。其次，要着力整合相关制度、政策和社会
资源，协同推进新农合制度发展，实行新农合制度与医疗救助制度的有机结合。2003—2006年，中央财政共投入18.5亿元支持农村医疗救助制度建设，在一定程度上解决了困难农民无力参合和无力支付大额医疗费用的问题。一些地方开展的补充商业医疗保险，红十字会开展的贫困农民医疗救助，又进一步解决了这方面的问题。事实上，还有许多在农村推行的政策，比如计划生育，扶贫开发，“降消”项目，艾滋病、血吸虫病、结核病和地方病等方面的防治政策，都可以通过部门协调，与新农合制度有效衔接。
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