酵母表达系统使用心得

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第一篇:酵母表达系统使用心得

Pichia酵母表达系统使用心得

甲醇酵母表达系统有不少优点,其中以Invitrogen公司的Pichia酵母表达系统最为人熟知,并广泛应用于外源蛋白的表达。虽然说酵母表达操作简单表达量高,但是在实际操作中,并不是每个外源基因都能顺利得到高表达的。不少人在操作中会遇到这样那样的问题,收集了部分用户在使用EasySelect Pichia Expression System这个被誉为最简单的毕赤酵母表达的经典试剂盒过程中的心得体会。其中Xiang Yang是来自美国乔治城大学(Georgetown University)Lombardi癌症中心(Lombardi Cancer Center),部分用户来自国内。甲醇酵母部分优点:

1.属于真核表达系统,具有一定的蛋白质翻译后加工,有利于真核蛋白的表达; 2.AOX强效启动子,外源基因产物表达量高,表达产物可以达到每升数克的水平; 3.酵母培养、转化、高密度发酵等操作接近原核生物,远较真核系 统简单,非常适合大规模工业化生产;

4.可以诱导表达,也可以分泌表达,便于产物纯化;

5.可以甲醇代替IPTG作为诱导物,部分甲醇酵母更可以用工业甲醇替代葡萄糖作为碳源,生产成本低。

产品性能:优点——使用简单,表达量高,His-tag便于纯化;缺点——酵母表达蛋白有时会出现蛋白切割问题。

巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)是一种能高效表达重组蛋白的酵母品种,一方面由于其是属于真核生物,因此表达出来的蛋白可以进行糖基化修饰,另一方面毕赤酵母生长速度快,可以将表达的蛋白分泌到培养基中,方便蛋白纯化。

毕赤酵母表达载体pPICZ在多克隆位点(MCR)3'端带有his-tag和c-myc epitopes,这些tag有利于常规检测和纯化,而且在MCR5'端引入了alpha factor(α-factor)用以分泌表达,并且在表达后α-factor可以自动被切除。在进行克隆的时候,如果你选择的是EcoRI,那么只需在目标蛋白中增加两个氨基酸序列即可完成。另外pPICZ系列选用的是Zeocin抗生素作为筛选标记,而诱导表达的载体需要甲醇——甲醇比一般用于大肠杆菌表达诱导使用的IPTG便宜。第一步——构建载体

Xiang Yang:pPICZ系列有许多克隆位点可供选择,同时也有三种读码框以便不用的用户需要。

红叶山庄:有关是选择pPIC9K还是pPICZ系列?pPIC9K属于穿梭质粒,也可以在原核表达,而pPICZ系列比较容易操作,大肠和毕赤酵母均用抗Zeocin筛选(PIC9K操作麻烦一点,大肠用amp抗性,而毕赤酵母先用His缺陷筛选阳性克隆,在利用G418筛选多拷贝),而且对于大小合适(30—50KD)的蛋白在产量上是pPIC9K无法比拟的。

leslie:要做毕赤酵母表达实验,首先当然就要了解这个可爱的酵母了(椭圆形,肥嘟嘟的,十分可爱),她和大肠杆菌长得有较大区别(大肠杆菌是杆状的),因此在培养的过程中要区别这两种菌体,除了气味,浓度,颜色以外,也可以取样到显微镜中观测。大家做毕赤表达的时候应该都遇过这种情况吧,表达过程中染菌(我们实验室曾经污染过各种颜色形状的细菌,那真是一段可怕的经历),如果在不知情的情况下继续做下去,那可以就是浪费大把的

时间了。

基本熟悉了毕赤酵母,了解了她生长的喜好(多糖偏酸环境),生长的周期等等情况后,当然更多的精力还是应该花在表达的目的蛋白上,我的表达蛋白有些恐怖,有100KD,本来当然应该放在大肠杆菌中表达,但是为了分泌表达(其实后来发现大肠杆菌pET系列分泌表达系列也不错)和糖基化修饰(主要是这个方面,因为我的蛋白是人源的,表达出来用于酵母双杂,因此需要有完备的糖基化修饰)。这样我的DNA片段由于较长,所以在做克隆的时候也要非常小心,需要注意的是:

①酶切位点不能出现在目的DNA片段中——如果片段长无法避免,可以采用平末端连接;

②虽然α-factor可以自动切除,但是在设计表达的时候,如果在N端不能出现任何多余的aa(比如药物蛋白表达),需要特别留意(说明书上有详细说明:P13);

③有三种不同的读码框(对于pPICZα系列来说就是对上α-factor序列),在设计克隆的时候要反复确定自己的读码框是否正确,这可是致命的问题;

④无论pPICZ还是pPICZα都有TGA(终止密码子),但是pPICZ系列没有ATG(起始密码子),有人认为酵母启动子与外源基因的ATG之间的距离越短对于表达的该基因越有利;

⑤如果不希望有c-myc和His-tag,可以在基因片段末尾加入终止密码子;

⑥Pichia的密码子与酿酒酵母的相似,有关基因表达偏好密码子的问题有人认为没有必要更换,有人认为一定要换,个人认为以产量为主要目的的可以考虑更换基因密码子,而如果片段过长就比较麻烦,不过有许多真核保守蛋白其实是和酵母密码子相似的;

⑦克隆菌株需要有recA,endA,试剂盒带有的TOP10挺好用的(其它像是DH5α都行),但是要注意带有筛选抗生素Zeocin的培养基要用低盐培养基(NaCl减半),这主要是因为怕影响到抗生素作用(Zeocin平板要避光保存);

⑧测序引物可以用α-factor信号引物,也可以用5'AOX1引物;

⑨如果需要高量表达,可以考虑做克隆的时候串联基因片段进行表达,另外也可以在转化酵母的时候重复转化。

⑩目的基因中最好不要含有pro-glu-ser-thr这样的序列,因为这个序列是激活蛋白水解酶的作用底物,会影响表达,另外也不要含有x-phe-x-arg-gln和gln-arg-x-phe-x这样的序列(x=任何氨基酸),因为这些序列容易受到容酶体的切割,而且目的蛋白末端最好是ala,asp,val,ser这样的氨基酸。除此之外许多高A+T含量的基因通常会由于提前终止而不能有效转录,也需要多加注意。

第二步就是将线性化的DNA转化入Pichia酵母中:

Xiang Yang:EasySelect试剂盒准备了三种菌株:X33,GS115和KM71H。我倾向于选择X33,因为这个菌株转化率和表达量相对而言较高,如果你有电转仪(electroporator),可以尝试一下。如果没有的话,EasySelect也准备了化学转化试剂——EasyComp Transformation,但是由于转化率的缘故,我建议使用电转仪。

leslie:在得到了正确的序列之后就可以准备转化毕赤酵母了,试剂盒携带有的是X-33,GS115和KM71H这三种毕赤酵母(另外常用的还有SMD1168),每种酵母的特点有些不尽相同

(Manual上写的很清楚),其中X-33由于是野生型,因此耐受性比较好,如果担心转化率的话可以考虑这种酵母菌,而GS115与X33一样都是属于MUT+表现型,也就是说可以在含甲醇的培养基中快速生长,但是据说会对外源基因表达有影响,KM71是MUT-型酵母,在甲醇培养基中生长缓慢,但是也有利于翻译后加工,比如形成二硫键,糖基化等等,另外SMD1168则是基因组中的Pep4基因发生突变,造成蛋白水解酶活性的丧失,可以保护表达产物免受降解,促进表达量的提高。

一般来说,如果是胞内表达,应尽量用Mut-细胞,这样得到的蛋白产物中醇氧化酶蛋白量较少而目的蛋白量相对较多(约占Pp总分泌蛋白量的30-90%,如人乙酰胆碱酯酶B变异链的含量占到90%,使下游纯化更易进行。而对于分泌蛋白的表达,无论是甲醇利用慢(Mut-)还是甲醇利用快(Mut+)的细胞都可应用,如在人血清白蛋白(HSA)(为分泌型蛋白)的表达中就看不出两种类型的细胞之间有什么明显差别。

所以一般手册都会建议同时在这几种菌株中进行转化,这主要是因为不同的基因在不同的酵母菌中可能表达量截然不同,因此在最开始的时候建议多用几种酵母菌实验。

另外有个保存问题,原始酵母菌一定要保存好,因为酵母在传代多次后会影响其转化率和表达量,所以一方面分多管分装保存于-80℃,另一方面如果出现了转化或者表达的问题,在其它方面都没有出错的前提下可以考虑重新取出新菌液(每次都要涂平板挑菌)。

在准备酵母菌的同时也需要准备质粒,由于酵母菌转化对转化质粒的要求较高,量也较大(5-10ug),因此许多时候都会用PEG大提质粒,或者用大提试剂盒,总而言之要准备好足够量的质粒,并且不要忘记也要同时准备空载体以做对照。在转化前质粒需要进行线性化,这主要是为了增加重组率(EasySelect试剂盒表达量高的一个重要原因也就在于其原理是将目的片段整合到载体上,大大的增加了目的片段的表达)。线性化位点个人认为也会影响到表达量,对于基因片段不大的蛋白可以考虑用几个线性化位点同时进行转化筛选,但是如果片段大,就有可能供选择的机会少,而且也有可能遇上没有合适的线性化位点的情况,这个时候也不是说不能进行表达,但是准备的质粒就要增加10倍,另外也可以进行部分酶切(即先进行预实验,掐定时间和酶量保证被切开的质粒有部分是在线性化位点切开而基因片段保存完好)。

在线性化之后的质粒就可以酒精沉淀回收了——中间步骤需要使酶失活,说明书建议是热失活或者EDTA,个人认为前者比较好,主要是担心EDTA对于转化的影响,另外这三种酶失活的温度都是65℃/20min。沉淀回收之后是离心10分钟,用80%的酒精洗涤后风干,这一步需要多加注意保证风干完全,因为有实验证明残留的酒精对于转化的影响颇大。

接下来就是酵母转化了,这是令许多人头疼的一步,也是影响实验决定表达的关键步骤。转化方法有不少,例如电转,化学转化,原生质体转化,其方法的难易程度和转化率高低呈反向递减的,也就是说电转最容易,转化率较高(但要求有电转仪),而原生质体最麻烦,而且效果不好(比较传统),因此不建议使用,EasySelect说明书上这么建议,并且也详细说明了电转,化学转化(EasyComp和LiCl)方法的过程,可以按部就班。需要注意的是(电转过程):

①最好每次都从平板上挑酵母菌,用培养过的酵母放置时间不要超过一个星期;

②扩大培养的浓度一定要控制好,个人认为不需要OD600达到1.3-1.5,1.0-1.3的就好,这个时候的酵母比较新鲜,转化率比较高; ③整个感受态制作过程中一定要在冰上操作,离心最好也用冷冻离心机,这是影响转化的关键——为了进一步保证这一点,无菌水可以是冰水混合物,另外山梨醇和电转杯都要预冷;

④电转仪需要预热,所以准备感受态的时候就可以把电转仪打开了,电转后山梨醇的加入要快,曾有人做实验证明晚一秒就会降低转化的数量级,虽然不一定可信,但是我个人也认为这个过程要快,电转后可以看看时间,如果时间过短(比如(4)就可能说明杂质较多,会影响转化率;

⑤转化后温育是个增加同源重组,增加存活率的过程,需要注意不要感染了大肠杆菌,再加入培养基30℃摇一段时间,可以取部分涂板(不同浓度抗生素),或者也有人将菌短暂离心,弃去上清,剩余全部涂板以保证转化率。

(化学转化)

如果没有电转仪,LiCl转化是一种可供选择的方法,转化率是102到103cfu/ug。

主要过程为: 取过夜活化培养的菌液按1:1000接种于15ml新鲜的YPD液体培养基,30℃培养至OD600达到0.8-1.0;4℃,4500rpm离心5分钟,用8ml冰预冷的无菌水洗涤菌体,倾除洗涤液,用1mL,4℃,4500rpm离心5分钟,沉淀用50μl冰预冷的100mmol/L LiCl悬浮,最后定容至80-90ml。

LiCl转化 取适量单链鲑精DNA(2mg/mL)煮沸5min,立即置于冰上备用,取上述制备好的感受态细胞12 000rpm,离心15s,吸弃LiCl溶液,按顺序依次加入 50%PEG240ml 1mmol/L LiCl

ml 单链鲑精DNA

25ml 线性化质粒DNA 10 ml(约10mg)用吸头反复吹打,使细胞沉淀与加入的溶液混匀,30℃静置温育30min,42℃热击20-25min,4500rpm离心10min,吸弃转化液,细胞沉淀加1ml YPD培养基于30℃ 200 rpm培养2-4hr,取转化混合液100ml涂布含100µg/mL ZeocinTM 的YPDS平板,30℃培养2-3天。

第三步——挑克隆筛选

Xiang Yang:在protocol中用了许多篇幅来指导这一步,包括如何去通过平板筛选,观测生长速率来确定Mut表现型等。这个过程需要3到5天,而我一般只用用了4个小时进行PCR(AOX引物)筛选。

leslie:完成转化后就是克隆鉴定的过程了,包括高拷贝筛选,PCR鉴定和表型鉴定的过程,其中我做的比较多的是PCR鉴定(因为比较快),具体过程protocol上说的很清楚,其实也很简单,就是冻融破菌进行菌落PCR,但是其中许多具体细节问题也挺让人头痛的,第一就是破壁的问题,许多人用PCR方法进行鉴定都无法得到结果,甚至在表达出了以后还是无法得到这张鉴定图片,主要原因之一就是无法正常释放酵母基因组,一般通过培养菌然后进行沸水和-20℃冷冻循环过程裂解细胞在目的蛋白片段比较合适的范围以内是可以得到好的结果的,但是有时候片段过长,模壁就会阻碍扩增,所以我们实验室会用蜗牛酶(很便宜的酶来的)来帮助溶菌,我看许多实验室也会这么做,不过加入的时间不同而已,其次也有奢侈的用试剂盒的。

第二就是是模板量,个人建议模板真的不要加太多了,按照说明书的上的5ul我觉得还是多了,而且建议总体积不用这么大,当然加入模板的量也与自己培养菌的浓度以及用来冻融的菌数量有关。其次是假阳性和假阴性结果,在Mut-和Mut+情况是不一样的,如果用的是5'AOX引物,KM71H会出现3.6kb的片段,而Mut+则会出现AOX1基因原本长度的片段——大约长2.2kb,因此如果的基因片段长度相似,要注意区分。建议PCR过程中使用多对引物进行反应,包括自己基因的,α-factor的,5'AOX的,都可以,反正各种对照多了有利于比较——当然前提是你不能晕了头。

掉了毛的鸵鸟:巴斯德毕赤酵母包含醇氧化酶-1(AOX1)基因的启动子的转录终止子(5’AOX1和3’AOX1),他们被多克隆位点分开,外源基因可在此插入,此外,载体中还包含组氨酸脱氢酶基因(HIS4)选择标记(HIS4区的整合方式为位点特异性单交换引起的基因插入,整合后使组氨酸缺陷型宿主(his4)恢复野生型.HIS4区或AOX1区位点的整合都使转化子具有HIS4基因,因而可利用表型差异进行筛选,酵母GS115具有组氨醇脱氢酶缺陷型基因his4,可接受含HIS4的载体而具有HIS+表型以筛选转化子.)及3’AOX1区,当整合型载体转化受体菌感受态细胞时,他的5’AOX1和3’AOX1能与染色体上的同源基因重组,从而使整个载体和外源基因插入到受体菌染色体上,在加入甲醇作为唯一碳源的培养基中,外源基因在5’AOX1启动子的控制下表达.在载体中引入Tn903Kanr基因(抗G418)有助于筛选高拷贝转化子,转化子的拷贝数与抗G418的能力有关,通过筛选抗G418能力强的酵母即可获得高拷贝转化子.外源基因是以同源重组的方式插入到酵母菌的染色体中,因此不易丢失,多次传代后酵母仍能稳定表达外源蛋白,具有良好的遗传稳定性.第四步——表达

Xiang Yang:将你的克隆在YPD培养基中培育到OD600值达到6.0,就可以离心收菌。用表达培养基(比如BMMY)重悬沉淀,在30ºC培育过夜。

leslie:筛选鉴定出自己的重组子可以说什么都不能证明,还是要看这一步的酵母表达,有许多人在酵母表达上花费了大量的时间——不同于大肠杆菌的两天出结果,一次毕赤酵母的表达就需要起码一周的时间,筛选了上百上千的克隆,但是仍然是竹篮打水一场空,我个人建议如果在筛选完3批以上就可以放弃这一批转化的酵母菌,另外调整进行重新转化。

另外刚开始的时候可以用小量表达,可以用5ml:生长慢型,生长快型,阴性对照(空质粒),阳性对照(可以是曾经表达成功的重组子)和没有进行转化的酵母菌的单克隆,BMGY中培养到OD值2-6,离心收菌(如果怕污染或者麻烦,可以放置酵母菌一段时间,一半为20-30分钟,让菌沉淀下来,小心倾倒去上清培养基获得菌),转入BMMY中诱导表达,这些步骤都需要在超净工作台里进行,如果要区分是否染菌,可以取一些到显微镜下观察,或者闻气味(酸甜的是酵母),观颜色(乳白色的是酵母)。除此之外,如果是小量表达,有可能会在没有达到4天的时间培养基就干了,所以可以适当补充一些,以及在摇床里放置盛有无菌水的深口瓶,来保持摇床里湿度。

诱导物甲醇注意要在超净台中打开,可以分装到灭过菌的瓶子中——当然甲醇是不能灭菌的,而且也要注意在用酒精灯过甲醇瓶口的时候要小心,如果真的引起爆炸那可就损失大了。另外如果觉得每天添加甲醇麻烦,也有人用一次性注射器透过纱布添加甲醇,这个方法可能会造成染菌,慎选。说到纱布就想到了通气性问题,酵母在无氧和有氧的情况下都可以存活,但是在甲醇诱导的情况下毕赤酵母用的是醇氧化酶,自然氧气量对于这一基因的表达影响重大,但是由于害怕感染大肠杆菌,纱布裹的也不能太少,最好专辟出一个摇床进行三十度酵母表达,这样可以考虑将纱布减少到3—5层,同时需要注意的是摇瓶内菌液体积不要超过10-30%。

每天取样出来进行SDS-PAGE电泳鉴定,能这样最好,不过每天做胶跑胶染色真的很麻烦,可以汇集一批同时跑,不过样品一定要煮过冻存,而且每次取样不要反复冻融,最好分装保存——因为蛋白经煮沸变性会不稳定,容易降解。另外为了防止蛋白在分泌出来的过程就降解了(特别是小分子蛋白),也可以通过调节培养基pH值抑制蛋白水解酶的活性(这一方面说明书讲解得详细),还可以加入酪蛋白氨基酸等保护物质,竞争性抑制蛋白水解酶 的活性来防止表达产物降解。

如果使用的是分泌型培养基,按道理收集培养基上清就可以进行下一步分析了,但是由于培养基中的蛋白浓度PAGE胶一般是检测不出来的——除非你的表达蛋白量非常大。所以需要进行浓缩,方法有TCA法,硫酸氨盐析,PEG沉淀,透析,超滤等等,当然最简单的就是煮沸蒸发水分浓缩了。另外跑胶的时候同时对照酵母胞内蛋白,以防没有分泌出来。SDS-PAGE的配置参见分子克隆,注意你的蛋白大小与胶的浓度的对应性,如果小到20kD以下,可以考虑用tricine胶,不过是个需要全盘重新准备的过程,要考虑清楚。如果选用的载体是带有信号肽的,虽说是分泌表达好纯化,但实际上毕赤酵母本身还是有本底表达的,而且有时候会造成假阳性,所以最后表达过程需要用Western blot或者Elasa,通常都是用WB,具体的细节可见Western Blotting前传:想成为高手吗?系列文章,另外要提一句的是,如果本身蛋白没有合适抗体(如果是利用从大肠表达出来的蛋白做出的抗体也有可能与用真核系统表达出来的蛋白无法发生免疫作用),可以选用anti-myc或者anti-his的,前提当然是你的蛋白没有提前终止。

其它在表达中可能出现的情况包括表达量低,没有分泌表达(针对pPICZa系列),头两天蛋白量较大,无法重复,表达出来的蛋白偏大等等,需要分各个方面分析原因,比如蛋白明明加上了信号肽,但是就是无法分泌出来,这可能是蛋白结构在通过细胞膜的时候受到了阻碍,可能需要重新转化,更换线性化位点或者更换菌株;如果蛋白表达第一天较高,但是之后越来越少,这很有可能是蛋白降解了或者产生了竞争表达;毕赤酵母无法重复的问题比较严重,许多情况下在第一次获得了高量表达之后就再怎么也重复不了这个结果,遇到这种情况真是令人非常痛苦,可是除了重新摸索条件还能怎么样呢?而表达出来的蛋白分子量偏大则是个正常现象,除了糖基化以外还有其它原因,比如二聚体,这些需要进行WB或进一步实验验证。

第五步——发酵和产物纯化

Xiang Yang:我用的是HisTraP Columns(GE Healthcare),经过简单的纯化之后我可以得到90%的目的蛋白。我的目的蛋白是一个大小为45kDa,可以通过二硫键形成反向平行二聚体(antiparallel homodimer)的糖蛋白,经过纯化,我通过一个细胞增殖实验(cell proliferation assay)检测了其活性,结果表明表达出来的蛋白在体外有完全的活性。并且我也在体外利用受体分析了蛋白结合活性,与对照(通过大肠杆菌和Bacular细胞未带tag的蛋白)相比,his-tag有一点副作用。

伊可丽:由于在摇瓶培养中巴斯德毕赤酵母表达外源蛋白的水平往往不能准确地反映罐发酵中的表达情况,使之成为令人头痛的问题。主要原因是在摇瓶培养中,培养液的pH值无法控制,培养物通气不充分及无法控制添加碳源的最适速率。但是为了避免对每一个表达菌株进行繁琐的发酵罐培养条件的实验,仍需摸索表达菌株的摇瓶培养条件,使其产物的表达量与预期的发酵罐培养结果相近。

总而言之,EasySelect系统是一个便于操作的酵母表达系统,我已经使用这一系统表达过15个类似物了,每一个我都获得了超过1mg/1升培养液的纯化蛋白。

第二篇:毕赤酵母表达系统简介

巴斯德毕赤酵母及启动子

1.1 毕赤酵母表达系统简介

随着蛋白异源表达的飞速发展,越来越多的表达系统被建立并得到应用。酵母作为单细胞真核生物,因具有比较完备的基因表达调控机制和对表达产物的加工修饰能力,仍表现出不可比拟的优势。以甲醇营养型酵母(Methylotrophic yeast)-毕赤酵母为代表的第二代酵母表达系统,是近年来被公认的最有效的外源蛋白表达系统之一,已有多种外源蛋白在该宿主系统中获得了成功表达[1]。作为生产外源蛋白的重要宿主菌,依靠其各种不同功能的表达载体,已经得到广泛的应用。表达的蛋白质包括酶、膜蛋白、抗原、抗体和调节蛋白等[2,3]。

毕赤酵母(Pichia pastoris)表达系统是近年来发展迅速、应用广泛的一种真表达系统。它是甲醇营养型酵母菌,有两个乙醇氧化酶(alcohol oxidase,Aox)码基因AOX1和AOX2,两者序列相似,AOX1基因严格受甲醇诱导和调控。当甲醇为唯一碳源时,AOX1启动子可被甲醇诱导,启动乙醇氧化酶的表达,从而用甲醇进行代谢[4]。含AOX1启动子的质粒可用来促进编码外源蛋白的目的因的表达。

随着Invitrogen公司开发的一系列毕赤酵母表达试剂盒的应用,目前用该统已成功表达出了数以千计的来自细菌、真菌、原生动物、植物、无脊椎动物、包括人在内的脊椎动物以及病毒等的具有生物学功能的外源蛋白或蛋白结构[5,6]。1.1.1 P.Pastoris表达载体及其元件

由于毕赤酵母没有稳定的附加质粒,表达载体需与宿主染色体发生同源重组,外源基因表达框架整合于染色体中以实现外源基因的表达整合表达的优点在于保持外源基因稳定性并可产生多拷贝基因。典型的毕赤氏酵母表达载体含有醇氧化酶基因的调控序列,主要的结构包括:5′AOX1启动子片段、多克隆位点(MCS)、转录终止和 polyA形成基因序列(TT)、筛选标记(His4或 Zeocin)、3′AOX1基因片段,作为一个能在大肠杆菌中繁殖扩增的穿梭质粒,它还有部分pBR322质粒或COLE1序列。如果是分泌型表达载体,在多克隆位点的前面,外源基因的5′端和启动子的3′端之间插人了分泌作用的信号肽序列。在这个分泌信号的引导下,外源蛋白在内质网和高尔基体中经修饰和加工后能够由胞内转移至胞外,将成熟的蛋白质分泌到细胞外。目前所采用的表达体均为穿梭质粒,先在大肠杆菌保存、复制、扩增,然后线性化后被导入宿主母细胞。

常用的表达载体包括胞内表达载体及分泌表达载体如下表:

表1 常用表达载体及其选择标记

表达方式 载体名称 pPICZA,B,C

胞内表达 pPIC6A,B,C PGAPZA,B,C

启动子 AOX1 AOX1 GAP

选择标记 Zeocin blasticidin Zeocin pPIC3.5K PAO815 PFLD pPICZαA,B,C pPIC6αA,B,C 分泌表达 PGAPZαA,B,C pPIC9k pFLDα

AOX1 AOX1 FLD AOX1 AOX1 GAP AOX1 FLD

His4 kanmycin ampicillin His4 ampicillin Zeocin ampicillin Zeocin blasticidin Zeocin

His4 kanmycin ampicillin Zeocin ampicillin

1.1.2 毕赤酵母表达系统的优势

自从1987年Cregg等首次用巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)作为宿主表达外源蛋白以来,作为一种新的高效的表达系统,毕赤酵母越来越引起人们的重视,到1995年,已有四十多种外源蛋白在该宿主菌中获得表达。而最近几年每年报道的在毕赤酵母中表达的外源基因就有几十种,且一年比一年多,它除了具有原核生物易于培养、繁殖快、便于基因工程操作和高密度发酵等特性之外,同酿酒酵母等传统真核表达系统相比,它还具有以下的优势:(1)含有特有的强有力的AOX(醇氧化酶基因)启动子,用甲醇可严格地调控外源基因的表达;

(2)培养成本低,产物易分离。毕赤酵母所用发酵培养基十分廉价,一般碳源为甘油或葡萄糖及甲醇,其余为无机盐,培养基中不含蛋白,有利于下游产品分离纯化;而酿酒酵母所用诱导物一般为价格较高的半乳糖;

(3)外源蛋白基因遗传稳定。外源基因能以高拷贝数整合到毕赤酵母基因组中,不易丢失并能够到高表达菌株;

(4)作为真核表达系统,毕赤酵母具有真核生物的亚细胞结构,具有糖基化、脂肪酰化、蛋白磷酸化等翻译后修饰加工功能。

1.2

AOX启动子序列分析现状

启动子是基因表达调控的顺式元件,也是基因工程表达载体的一个重要元件。启动子在转录水平上的重要作用,不仅决定了基因的表达水平,也决定了基因表达的时空顺序[7,8],可以说启动子活性的高低在很大程度上影响着基因表达最终产物的表达水平。所以找到一个转录启动功能较好的启动子,对于外源蛋白高效表达的研究具有重要的意义。目前,已有不少的启动子被克隆和功能鉴定[9]。

新型疫苗主要包括亚单位疫苗、基因缺失疫苗、核算疫苗、重组活载体疫苗等,尽管大多数被认为较为安全,但往往都需要免疫刺激性强的佐剂来提高免疫效果。菌蜕疫苗可通过发酵大量生产且无需加入佐剂即可获得坚强的免疫效果。

目前,毕赤酵母表达系统中较常用的表达载体有两类[10]:种是分泌型表达载体(如pPIC9K),另一种是组成型表达载体(如pGAPZB)。前者(以pPIC9K为例)含有的醇氧化酶启动子pAOX1,可以在甲醇的诱导下高效表达。该载体自身携带有α 分泌信号肽,可以将外源蛋白直接分泌到胞外。后者(以pGAPZB 为例)含有三磷酸甘油醛脱氢酶基因启动子pGAP,可以在多种碳源如葡萄糖、甘油、甲醇或油酸条件下表达外源蛋白,且不需添加诱导物[11]。

在启动子功能的研究中,多数是利用报告基因的表达量来达到功能研究的目的,常用的报告基因有绿色荧光蛋白GFP(green fluorescent protein)、红色荧光蛋白RFP(red fluorescent protein)β-葡糖醛酸糖苷酶GUS(β-glucuronidase)和氯霉素乙酰转移酶CAT(chloramphenicolacetyltransferase)等[12,13]。在前期的工作中,克隆了启动子pScgpd,并在巴斯德毕赤酵母中研究了AOX1 启动子的功能[14]。实验以人血清白蛋白(HSA)作为报告基因,在Pichia pastoris GS115中表达。

到目前为止,利用AOX启动子表达的蛋白有很多,例如:在AOX1(醇氧化酶)启动子调控下,类似天然抗菌肽大小的magainin 及cecA-mil 蛋白获得分泌表达[15];人前列腺特异性抗原的表达[16];重组木糖异构酶的分泌和表达[17];人骨唾液酸蛋白的表达等[18]。

第三篇:酵母表达系统概述及相关研究进展

酵母表达系统的研究进展和前景

(XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX学院)

摘要:酵母表达系统在表达真核生物蛋白方面已经得到广泛而成功的应用,表达出的重组蛋白表现出较高甚至比原物种体内的蛋白质更高的生物活性。近年来,利用酿酒酵母和毕赤巴斯德氏酵母表达人源蛋白或肽类活性物以及其它中间体取得了新的进展。本文主要从上游设计,重组表达,分离纯化和活性验证等方面进行了总结,并且对未来更好的利用酵母生产药物等活性物质作出展望。

关键词:酵母表达系统;蛋白分泌:异源基因;糖基化修饰;人源活性药物

引言

酵母作为一种表达外源基因的宿主菌, 既具有操作简单, 生长快等特点, 又具有真核细胞的翻译后修饰加工系统。在表达某些基因工程产品时, 可以大规模生产, 从而有效地降低成本。常用的酵母表达系统有酿酒酵母表达系统, 甲基营养型酵母表达系统和裂殖酵母表达系统。酿酒酵母(Saccharomyces.cerevisiae)在分子遗传学方面被人们的认识最早,也是最先作为外源基因表达的酵母宿主。但由于酿酒酵母的局限,1983 年美国Wegner 等人最先发展了以甲基营养型酵母(methylotrophic yeast)为代表的第二代酵母表达系统。其中毕赤酵母(P.pastoris)是继S.cerevisiae 之后被迅速推广的一种外源基因表达的宿主菌。

酿酒酵母难于高密度培养,分泌效率低,几乎不分泌分子量大于30 kD的外源蛋白质,也不能使所表达的外源蛋白质正确糖基化,而且表达蛋白质的C端往往被截短。因此,一般不用酿酒酵母做重组蛋白质表达的宿主菌。但是,可以通过基因敲除或改造用酿酒酵母表达亚单位疫苗(如HBV疫苗、口蹄疫疫苗等)或非蛋白活性物质及其中间体(如青蒿素,色素)。与原核和其它真核表达系统相比,巴斯德毕赤酵母作为重组蛋白表达系统有以下优点

[1]:(1)生长速率快,易于高密度培养(2)在几乎不含蛋白质的培养基中具有高水平产率

(3)消除了内源毒性和噬菌体感染(4)易于对具有明确特征的酵母表达载体进行操作(5)对毕赤酵母的噬菌体对人没有病原性(6)具有多种翻译后修饰包括多肽折叠,糖基化,乙酰化,甲基化,蛋白质降解调控以及定位至亚细胞结构(7)能够构建分泌的蛋白,这样只需从生长培养基中提纯而不必收集酵母本身细胞。

基因工程与酵母表达系统

即使酵母表达系统具有一些优势,但在用于生产蛋白质等药物时,还需要选择合适的载体并对宿主菌的某些代谢途径进行改造,使之利于目标产物的表达,要用于工业生产,还需根据实际情况优化培养条件,比如pH,温度,溶氧量,培养基营养,特殊添加剂等。

酿酒酵母的表达载体有自主复制型和整合型,自主复制型质粒通常有30个或更多的拷贝,含有自动复制序列(automaticreplicating sequence,ARS),能够独立于酵母染色体外进行复制,如果没有选择压力,这些质粒往往不稳定。整合型质粒不含ARS,必需整合到染色体上,随染色体复制而复制。整合过程是高特异性的,但是拷贝数很低。为此,人们设计了pMIRY2(for multiple integration into ribosomal DNin yeast)质粒,旨在将目的基因靶向整合到rDNA簇上(rDNA簇为酵母基因组中串联存在的150个重复序列),因此利用pMIRY2质粒可以得到100个以上的拷贝。值得注意的是,酿酒酵母表达的外源蛋白质往往被高度糖基化,糖链上可以带有40个以上的甘露糖残基,糖蛋白的核心寡聚糖链含有末端仅1,3甘露糖,致使产物的抗原性明显增强。

毕赤酵母的表达载体多采用整合型载体,即将异源基因通过载体整合进酵母基因组中,这是由于没有适合毕赤酵母的游离型表达载体。所有巴斯德氏毕赤酵母的表达载体都是一个表达组件,它由一个启动子序列(大多是AOX1启动子),一个来自AOX1的转录终止序列用以指导3’终止过程和mRNA的多聚腺苷酸化,在它们之间有一个或多个克隆位点用以插入外源基因。这样的设计保证了产物(cap-AOX1 5′UTR-ORF-3′UTR-polyA)是一个成熟的mRNA以适应毕赤酵母的细胞体系,确保了信息的稳定性和有效性。检测表达所用的标记基因一般是HIS4(组氨醇脱氢酶基因),有时也用kan(卡那霉素抗性基因)或Sh ble.此外,有时为了防止酵母自身蛋白酶对所要表达的异源蛋白的降解,会使用蛋白酶缺陷突变型或降低发酵温度,保证目的蛋白的产量和得率。发酵过程一般分两个阶段,第一阶段是细胞以甘油为碳源生长,甘油耗尽后进入第二阶段,加入甲醇诱导AOX1启动子的转录翻译,从而使异源基因表达,生产目标蛋白。

酵母表达系统研究进展

1. 利用酿酒酵母生产青蒿素前体——青蒿酸

青蒿素(Artemisinin)是目前治疗疟疾的高效药物,这主要是由于疟原虫(Plasmodium falciparum)逐渐对其它药物产生了抗药性。现在青蒿素的产量远达不到需求量,所以Jay D.Keasling 等人通过酿酒酵母生产它的前体——artemisinic acid,成本低,环保,可作为高质[2]R

量和可靠的青蒿素来源。这个实验通过改造甲羟戊酸途径,引入两个来自青蒿(Artemisia annua)的外源酶amorphadiene synthase(ADS)和cytochrome P450 monooxygenase(CYP71AV1)使酿酒酵母获得将amorpha-4,11-diene氧化为artemisinic acid的三步途径。同时,还导入了CYP71AV1的天然氧化还原配体CPR(cytochrome P450 oxidoreductase),在这之前,还需将法尼基焦磷酸即FPP(farnesyl pyrophosphate)的合成途径修饰,减少它用于固醇的合成,使之更多的用于合成amorphadiene。然后,利用改造的酿酒酵母EPY224生产artemisinic acid,不仅纯度较高,易于提取分离,而且不受气候影响。

2.利用毕赤巴斯德氏酵母生产人源抗菌肽——LL-37

抗菌肽是生物体抵御外源性病原体的防御反应中所产生的一类小分子多肽。许多传统的抗生素具有毒副作用且能够诱导耐药菌株的产生,发展克服耐药性问题的新型抗生素显得越来越重要。抗菌肽具有分子质量小、水溶性好、耐热性强、无免疫原性、抗菌谱广和作用机制独特等特点,还有研究表明,hCAP(Human cathelicidin antimicrobial peptide)是人皮肤在受伤或炎症刺激下,嗜碱性粒细胞分泌的一种防御或抗微生物的肽,在人类中只有LL-37一种。固相化学合成技术可以生产像肽这样较短的氨基酸序列,不过成本太高。Yong-Seok Kim等人[3]利用pGAPZ-E(pGAPZB载体的游离形式)将编码成熟LL-37的111bp的基因片段采用电穿孔方法转化到P.pastoris X-33中,进行细胞内表达,表达的重组LL-37通过LC-ESI-MS/MS检测确定,发现有5kDa的LL-37条带。酵母的表达出来的LL-37的粗提取物对Micrococcus luteus具有抑制活性。表达载体采用GAP强启动子,另外还进行了有a-MF外分泌信号的载体pGAPZaA,结果采用这个载体的X-33培养物中没有发现胞外分泌的LL-37.另外还利用蛋白酶缺陷型菌株SMD1168H进行了转化,LL-37在其中的表达水平与在X-33中的没有显著差异。这个实验说明了利用游离型表达载体在P.pastoris X-33中可以成功表达LL-37,并且具有生物活性,可以用于生产这类抗菌肽药物。

3.人源化的毕赤酵母生产糖蛋白类药物

人体内,除了抗体外的大多数糖蛋白的半衰期和治疗潜力依赖于末端的唾液酸化,这是由于一个糖蛋白的其它末端糖比如甘露糖,N-乙酰葡糖胺和半乳糖等会被体内的糖特异性受体或凝集素识别并被清除,也就失去疗效了。酵母和丝状真菌在表达这类糖蛋白方面具有一定前景。用酵母表达在人体内具有活性的糖蛋白需要进行很多基因删除或修饰,Tillman U.Gerngross等人[4]利用毕赤酵母构建出能表达重组红细胞生成素(EPO)的菌株P.pastoris YSH597。这个菌株是在以前的菌株RDP762基础上利用pSH926载体引入了5个新的外源基因构建成的,为的是使这个酵母能完成人源的末端唾液酸化。对天然酵母的改造设计到四个酵

母特异性糖酰化基因的敲除和14个异源基因的导入。利用SDS-PAGE和HPLC提纯分离的重组EPO具有与剂量相关的生物学活性。EPO是一种高度糖基化的蛋白质,利用酵母表达需要在N-乙酰葡糖胺或甘露糖等修饰后再加上人源的唾液酸化过程,才能产生有活性的EPO(已经进行动物试验)。这项研究表明利用酵母生产EPO等同类糖蛋白具有可行性,不仅能节省时间,而且节约成本,大量生产以缓解对这类医疗药物的需求。

酵母表达的糖蛋白不同于哺乳动物表达的杂合型或复杂型糖蛋白,而是高甘露糖型或过度甘露糖化糖蛋白。杨晓鹏等人[5]在前期成功敲除毕赤酵母α-1,6-甘露糖转移酶(Och1p)基因、阻断毕赤酵母过度糖基化,获得毕赤酵母过度糖基化缺陷菌株GJK01(ura3、och1)的基础上,构建了PGE-URA3-PNOI-GAP-signal-MDSI载体,通过表达不同物种来源的α-1,2-甘露糖苷酶I(MDSI)的活性区与酵母自身定位信号的融合蛋白,并通过DSA-FACE(基于DNA 测序仪的荧光辅助糖电泳)分析筛选报告蛋白HSA/GM-CSF(人血清白蛋白与粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子融合蛋白)的糖基结构,发现当编码酿酒酵母α-1,2-甘露糖苷酶(MnsI)基因的内质网定位信号与带有完整C-端催化区的拟南芥MDSI基因融合表达时,毕赤酵母工程菌株能够合成Man5GlcNAc2 哺乳动物甘露糖型糖蛋白。这为在酵母体内合成类似于哺乳动物杂合型或复杂型糖基化修饰的糖蛋白奠定了基础。

4.在巴斯德氏毕赤酵母中高水平表达一种合成酶——植酸酶

植酸(Phytate),即肌醇六磷酸(IP6),是植物种子中磷元素的主要储存形式, 普遍存在于植物性食品和饲料。人和单胃动物畜禽和鱼类等缺乏内源性植酸酶不能利用有机植酸磷。饲料中常添加无机磷酸盐以满足单胃动物的磷营养需求,随之产生了诸多问题,最主要的是植酸作为一种抗营养因子,在体内络合多种矿质元素和蛋白质等,常引起人和单胃动物各种营养不良症,而且未被利用的植酸磷被微生物降解释放无机磷易引发水体磷污染。植酸酶(Phytase)是一类特殊的正磷酸单酯磷酸水解酶,催化植酸水解生成低级肌醇磷酸衍生物和无机磷酸,在动物营养、资源环境保护和人类健康等领域愈来愈显示出巨大的应用潜力和研究价值。植酸酶普遍存在于植物、真菌、酵母和细菌,其中微生物植酸酶因活性高、生产比较容易等诸多优点,对其研究和开发最为广泛和深入。Ai-Sheng Xiong等人利用一种担子菌隔孢伏革菌(Peniophora lycii)的植酸酶[6](一种6’-植酸酶)基因,优化出适合P.pastoris的密码子的基因序列——phy-pl-sh,连接上信号肽MF4I的基因,采用含有AOX1启动子的pPIC9K载体,转化并使毕赤酵母GS115合成并分泌了植酸酶,产量为12.2g/L.控制的培养条件是:30°C,pH5.5,溶氧量30%,高密度培养。酶蛋白检测和酶活测试发现,酶的糖基化较严重,用水解酶Endo Hf在37°C下处理提纯的酶蛋白4h,得到的片段较均一,且在pH4.5下具有最大

酶活力。对基因稳定性和酶的热稳定性检测发现效果良好,此外他们还利用DNA Shuffling获得了几种热稳定的酶的候选基因,这项研究表明利用毕赤巴斯德氏酵母生产6’-植酸酶具有很大潜力,可以用于工业生产。

5.毕赤酵母表达大分子类药物

在毕赤酵母表达系统表达具有生物活性的CTP-SOD 融合蛋白,显著地提高了SOD 保护HeLa 细胞免受氧化损伤的能力。细胞质转导肽(CTP,一种能够携带外源大分子穿过细胞膜,定位于细胞质的短肽)运输人铜锌超氧化物歧化酶(Cu/Zn SOD)跨过细胞膜进入细胞质,可以提高其生物利用度。李沛志等[7]利用P.pastoris GS115(his4-)及其整合型分泌表达质粒pPIC9K转化表达了融合蛋白CTD-SOD。首先,设计含有CTD转导肽基因序列的融合基因,连接至pPIC9K 质粒并用它转化E.coli Top10并进行菌落PCR筛选,抽提出重组质粒并电击转化巴斯德毕赤酵母,将转化成功的酵母接种到YPD 培养基中,通过加入甲醇至终浓度0.5%诱导表达。培养结束后分析发酵液中诱导蛋白的表达量,纯化后并进行对细胞的保护作用测试。本研究成功地在毕赤酵母表达系统中高效表达了具有生物活性的CTP-SOD 融合蛋白,发酵上清中重组蛋白的含量为156.5 mg/L。纯化得到的CTP-SOD 分子量约为22.5 kDa。CTP-SOD 预处理Hela 细胞可显著地提高了邻苯三酚(Progallol)诱导氧化胁迫下HeLa 细胞的存活率,较野生型SOD 相比具有较强的保护作用。但是,CTP 和其他种类的PTD(蛋白转导域,Protein transduction domain)相比是否更有利于SOD或其他在细胞质中起作用的药物发挥功能都有待进一步深入的研究来证明,具有跨膜转导能力的新一代药物运输载体PTD 将会促进多肽、核酸等大分子药物的快速发展,为生物大分子药物的应用带来更广阔的前景。

在哺乳动物中, 三叶型家族(trefoil factorfamily, TFFs)蛋白通过增强细胞迁移,促进细胞增殖,对抗细胞凋亡等过程参与黏膜的修复并维持其完整性。Bm-TFF2, 一种从大蹼铃蟾皮肤分泌物中分离得到的两栖类三叶因子, 具有比人三叶因子更强的生物学活性。余果宇等人

[8]以Bm-TFF2 的cDNA 为模板, 利用PCR 方法扩增Bm-TFF2 基因, 然后插到含有AOX1 启动子和α-因子信号肽序列的表达载体pPIC9K 中, 采用毕赤酵母表达系统进行分泌表达, 并用G418 筛选高拷贝整合转化子。SDS-PAGE 和Western blotting 都检测到Bm-TFF2 被分泌性表达于酵母上清。在1%的甲醇诱导表达不同时间后, 重组蛋白在72 h 的表达量最大, 可达50 mg/ L;而不同浓度的饱和硫酸铵沉淀菌液上清时, 80%的饱和硫酸铵沉淀量最大。这些结果表明, 重组质粒Bm-TFF2-pPIC9K 成功构建并在真核细胞中高效表达, 这为进一步研究Bm-TFF2 的生物学活性及其结构与功能关系奠定了基础。

6.毕赤酵母在表达病毒蛋白用于疫苗和诊断方面的应用

人轮状病毒的VP7 基因目前已有用大肠埃希氏菌、乳酸杆菌,植物和哺乳动物细胞等表达系统的报道,而酵母表达尚未见报道。利用巴斯德毕赤酵母表达轮状病毒的保护性抗原VP7,以制备轮状病毒基因工程疫苗,可为预防轮状病毒感染提供一条有效途径。卢颖等人

[9]将已构建的重组质粒VP7-pPICZαA 经SacⅠ线性化后,通过电转化法转入毕赤酵母GS115中,然后Zeocin平板筛选并进行PCR鉴定及Mut 表型筛选,成功构建VP7 基因的重组酵母表达系统,为进一步表达VP7 基因提供理论依据和实验基础。

为了分析真核体系中表达的乙型脑炎病毒E蛋白的生物学特性,张健等人[10]以乙脑病毒SA-14 株为代表,构建了E 蛋白基因的毕赤酵母表达系统。首先,应用RT-PCR 法扩增乙型脑炎病毒E蛋白表达基因,定向克隆入载体pPICZαA,然后将重组质粒以PmeⅠ线性化并电转化入毕赤酵母GS115 感受态细胞,最后用Zeocin筛选转化子进行鉴定。PCR 扩增产物约为1 350 bp,定向克隆获得pPICZαA-E 表达载体,经测序结果与Genbank 相应序列比较,核苷酸序列同源性为100%,电转化得到巴氏毕赤酵母重组菌株GS115-E,提取其基因组DNA 经PCR鉴定与预期相符。本研究构建的乙型脑炎病毒E 基因毕赤酵母表达系统为进一步进行E蛋白真核表达研究奠定了基础。

酵母表达系统表达病毒蛋白抗原还在血清学诊断方面有所进展。于天飞等人[11]在多酵母表达系统(GS115/pPIC9-TY,GS115/pPIC9K-ts(Mut+),KM71/pPIC9-ts)中表达了含有猪传染性胃肠炎病毒S 基因B 和C 抗原位点片段。经检测表明,不同类型酵母表达系统蛋白表达量和抗原性差异不大,研究中获得的重组蛋白为建立TGE血清学检测方法提供了必要的物质基础.本试验所获得蛋白为PRCV S蛋白缺失部分,以此重组蛋白作为诊断抗原建立的血清学诊断方法可望避免潜在的PRCV感染对检测TGE的干扰,得出筛选生长速度较快的GS115/pPIC9-TY适合作为今后进一步应用的候选重组菌.

总结

由于酵母表达外源蛋白,特别是药用蛋白质的种种优势,促使研究人员不断改进酵母的遗传特性和生理特性。这些突破更加提高了酵母在生产药用蛋白中的应用。在工作中对不同来源、不同作用特点外源蛋白的研究和开发应用,毕赤酵母表达体系是一个很好的选择,我们需要综合考虑这一表达体系的上述特点,对目的外源蛋白基因进行相应的改造,设计合理的构建策略,使重组外源蛋白按我们的要求进行表达,有助于获得大量有活性的表达产物。相信这一表达体系的采用和不断深入研究势必为基因工程药物的发展提供加速度。

参考文献

1.V.Renugopalakrishnan, et al.Expression of recombinant proteins in Pichia pastoris.Appl

Biochem Biotechnol 2007;142:105-124.2.Dae-Kyun Ro, et al.Production of the antimalarial drug precursor artemisinic acid in engineered yeast.Nature 2006;440:940-943.3.In Pyo Hong, Sung Jae Lee, Yong Seok Kim, Shin Geon Choi.Recombinant expression of human cathelicidin(h CAP18/LL-37)in Pichia pastoris.Biotechnol Lett 2007;29:73-78.4.Tillman U.Gerngross, et al.Humanization of yeast to produce complex terminally sialylated glycoproteins.Science 2006;313:1441-1443.5.Xiaopeng Yang, et al.Construction of yeast Pichia pastoris to produce Man5GlcNAc2 mammalian mannose-type glycoprotein.Chin J Biotech 2011;27:108-117.6.Aisheng Xiong, Quanhong Yao, et al.High level expression of a synthetic gene encoding Peniophora lycii phytase in methylotrophic yeast Pichia pastoris.Appl Microbiol Biotechnol 2006;72:1039-1047.7.李沛志,任军乐,安婷,刘堰.融合蛋白CTP-SOD 在毕赤酵母中的表达、纯化及抗氧 化能力.生物工程学报 2010;26:324-329.8.余果宇,张红芸,张勇,江萍,李文辉,张云.Bm-TFF2 在毕赤酵母中的表达及鉴定.动物学研究 2010;31:565-569.9.卢颖,佟伟,单颖,张轶博,吴囡,董颖,李华,吴学敏.人轮状病毒外衣壳糖蛋白VP7 基因毕赤酵母重组表达系统的构建.现代预防医学 2010;37:3523-3528.10.张健,李一卿.乙型脑炎病毒E 蛋白毕赤酵母表达系统的构建.天津医科大学学报 2009;15:40-43.11.于天飞,黎明,吕建伟等人.TGEV 截短S 基因片段在多酵母表达系统中的表达.高师理科学刊 2011;31:73-75.

第四篇:做酵母四个月的心得

还有个奇怪的现象,2天的时候克隆直径不到2MM,还是乳白色的,长到第3天后居然变成粉红色的了,有的板红色的程度更深一些

查资料,考虑有2个原因:1,长的时间太长,菌种老化了

2,培养板上的Ade含量不足,产生了代谢产物是粉红色的(这一现象别人在实验中也出现了)

3.也有人解释说是后期ade不足

般酵母双杂交的bait序列不超过2000bp比较合适,这是因为

1、酵母的密码子和人的密码子有偏好性的差异,当基因超过2000bp后,密码子偏好性的累积效应造成蛋白翻译困难;

2、过大的bait蛋白的空间位阻效应会影响Gal4的AD和BD的互做,就会造成即使bait和prey有互做时,Gal4的BD和AD没有互做,从而不能激活报告基因表达。你的基因2346bp,对酵母来说,翻译比较困难,所以,酵母生长缓慢,你可以考虑将你的基因分成两段,分别用于筛库。

第五篇:畅言语音教具系统使用心得

畅言语音教具系统使用心得

作为一名农村小学的英语教师,我一直都有一个愿望:让学生在每节课的课堂上都能听到地地道道的英语口语,师生畅言语音在课堂上用英语畅所欲言。但是由于多方原因,要达到这种境界似乎很难。

最近“畅言智能语音教具系统”的到来,让我的教学工作有了新的起色。一开始看到畅言智能教具,并没有在意。后来在慢慢的摸索,逐步使用的过程中,我终于体验到了它强大而奇妙的功能。现在,我在教学中已越来越离不开它了。我认为这套教具对于英语教师自身素质、英语课堂教学效果和学生的综合能力等各方面的提高有着重大作用。

下面就简单谈谈使用畅言语音教具的体会:

一、简单方便易操作,提高教学效率。

首先,畅言智能语音教具系统用法非常简单,教师只需用识别笔点击课本上的内容,主机就朗读相应的英文单词、句子,唱歌曲歌谣等等,不但节省了录音机倒带的时间,而且解放了教师。这样一来教师可以巡视、关注每一个学生的情况,了解学生学习效果,适时指导,增大了课堂容量。

其次,识别笔可以一笔多用,除了点击要播放的内容以外,识别笔的激光灯可以当作教鞭使用,引导学生观看要学习的目标;识别笔上的任意功能键还可以帮助维护课堂秩序,提醒学生们集中注

意力;另外在课堂上需要结束学生热烈讨论的时候,用此键可以起“唤醒”和“终止”的作用,提高了各个教学环节的学习效果。

二、优化英语课堂,调动学生学习英语的积极性。

传统的英语课堂教学,组织形式单一。只有老师的讲解、提问、学生的回答、跟录音机反复读,很难吸引学生的注意力,智能语音教具系统给这样的课堂注入了新的活力。

畅言智能语音教具中语音合成,自制教具的功能,可以把任意实物,图片,卡片等制成生动有趣的有声教具,让他们自己开口说英语,还可以利用人与主机对话交流,使英语课堂变得更加直观、形象、真实、从而课堂变得生动活泼有趣。例如,在讲动物单词的时候,我自己录制了猫和狗的叫声,来引入单词教学;讲蔬菜水果单词时,我将相应单词读音输入识别码中,然后贴到相应图片上,用笔一点就能说话,这样一来,学生觉得很奇妙,自然兴趣就提高了。还可以利用合成声音,选择女声或男声朗读,使学生在纯正的语言中感知英语。并通过有声实物,标准声音,有声图片等把枯燥的单词,抽象的叙述以生动活泼的形象显现出来,使学生的大脑变得异常兴奋,注意力非常集中,学习的积极性随之调动起来。

三、提高教师自身素质,促进学生的发展。

畅言智能语音教具系统提供的“发音评测”、“中英文朗读”功能为我们教师自身发展提供了很好的学习工具,在一定程度上也促进了学生的发展。

“发音评测”相当于随时随地的口语校正“老师”,利用它可以对教师自己的发音进行测试,比较差异,提高发音的标准度。也可以对学生单词、句子和篇章的发音准确性进行评测,系统立即打分,得出错对辨率,我们可以对照标准,改正错误的发音。

“中英文朗读”功能中的“每日推荐”板块提供了大量的英文阅读材料,是老师提升英语阅读及听力能力的绝妙的好机会,每日内容不同,涉及面广,我们不需要花大量的时间和精力去寻找或购买英语报刊等,很轻松地就能增加我们的课外知识,提高我们的语言综合运用能力。

除此之外,畅言智能语音教具系统还有许多重要的功能:

第一,畅言智能语音教具系统实现了中英文对照朗读功能,这 是区别于其他英语语音教具的一大亮点。

一般的语音教具仅能播放英语课文的朗读,很难实现英汉同步播放。为了能更好的利用畅言智能语音教具软件系统解决此类矛盾,服务于现代英语教学,我的想法是:在语音合成过程中同时输入英文和中文,对发音人进行配合选择,这样便可以听取中英文对照的朗读,解决了部分学生的听力理解较差的难题。具体的做法是将手头的中英文对照文本,或者是一段中文一段英文的文本上传至畅言智能语音教具软件,在软件的“高级朗读模式”中,可以用中文发音人(“中文男声”或者“中文女声”)来朗读中文,用英文发音人(“英文男声”或者“英文女声”)来朗读英文,这样,就可以听到中英文对照朗读了。若有的中英文对

照文本,英文较简单只需要朗读英文部分,而中文部分不需要朗读,那么可以这样设置:选择英文部分,选择英文男声或女声发音人;选择中文部分,选择“不朗读”即可。

第二,借助畅言智能语音教具中英文“高级朗读模式”你还可以根据课文的难易,学生的反应适当调节朗读的速度,获取最佳的听觉效果。

第三,系统软件上附带的“生词表”可以说是一本“活字典”,不仅可以帮助教师和学生查找任何一个生疏的单词,还可以点读、跟读、模仿,一定程度上降低了学生出现哑巴英语的可能性。从“生词表”中,可以看到生词以字母顺序进行排列,当鼠标指向某个词语或短语时,会给出词语相应的解释,使用者可以点击“试听”来听取标准的读音。最为便捷的是,用户还可以任意搜索需要的词语或者选择是否需要显示词语的解释,这样为使用者提供了很大的方便。

总之,智能语音教具的到来,对我们广大英语教师来讲真是增添了一个好帮手,它给我们带来了很大的的方便,丰富了教学手段,使课堂生动起来,给学生带来了学习英语的好环境,大大调动了学生学习英语的积极性,增强了学习兴趣。相信,在我和它以后相处的日子里,我会进一步加深对它的认识,更好的将它应用于现代英语教学中。

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