“实用生物信息技术”课程总结

第一篇：“实用生物信息技术”课程总结

“实用生物信息技术”课程总结

1.收获

1）学会了资源搜索。研究生的一个必备工作是读阅读文献，分析文献，但我在文献搜集方面知识比较欠缺，本科的时候使用比较多的是学校图书馆数据库，万方数据库，中国知网等，而对于专业外文文献的搜集并不会。我觉得上实用信息技术课最大的收获是如何搜索自己需要的文献。文献搜索的讲解主要放在第一次课和第二次课。当时就觉得没有白选这门课，这门课的确很实用，作为一个辅助工具辅助我的学习。主要搜索基本可以通过abc主页进入，包括PDB, NBCI, Uniprot等。

2）加深了课题认识。除了本科期间做的实验，毕业后我没有参与研究所实验室的实验，这使我对本研究所本团队的研究领域并不清楚，尽管也咨询了师兄师姐但认识仍然比较浅。但在罗老师的严格要求下，通过不断与导师联系，我对本实验室的认识也加深了，对自己将来可能研究的课题有了更进一步的了解，这对于我今后进实验室进行研究有了积极的作用。3）了解了分析工具。

在整个课程中，老师讲解了各种蛋白质集基因序列的分析工具，使我倍感受益，以前在课堂上看到的蛋白质结构图，在论文上看到的序列比对分析图，自己也能做出来的时候真的很有成就感，原来未知的知识有这么多。今后我也会继续练习，争取熟练运用老师上课讲的各种工具。这些工具主要有：Weblab分析平台（Emma多序列比对，coderet获取全长基因组的对应序列），Blast数据库相似性搜索，Mega软件的使用，Swiss-PDB viewer蛋白结构比较软件。

2.感悟

用在学习上再多的时间也不过分。Half a day on abc saves a month in the lab。这句话对我启发很大，有的知识你感觉很难，但是只要肯下功夫，一切难题都会迎刃而解，更何况现在所碰到的根本不是大的难题，而仅仅是因为自己对专业课题的认识不深或者基本知识没有掌握而遇到的问题，这些问题基本上通过查阅文献和阅读使用说明就能够解决的。

3.遗憾

最遗憾的是自己对自己的课题没有非常深入的了解，仅阅读了几篇文献，因此在课程操作当中，并没有尽善尽美的对自己的课题完成一个深入的报告。

4.计划 接下来，我会将进一步深入探究自己的课题，利用上课所学知识完成对自身课题的初步研究，以北大同学做的报告为鉴，对自己的课题做一个完美的报告。

最后一堂课来的很匆忙，没想到这次竟然是我们实用生物信息技术的最后一堂课，真的舍不得。感觉要学的东西真的刚刚开始，我们这几天的学习在abc无限的资源里面真的是九牛一毛，那么多的Tools，Literature，database我们都还没怎么接触。老师说有些人可能一辈子都用不完。这么多宝贵的资源在这儿，我们怎能浪费。如果不能好好利用这些前人总结下来，创造下来的资源，那真的是太可惜。

我觉得能够碰到这样一位教学严谨的老师，是我们莫大的福分。虽然基本操作都会了，但仍然需要认真练习，利用例题同时也利用自己课题的研究对象寻求更好的方法去得到自己想要的结构。当然里面还有很多需要我们继续探讨的操作，这些都需要我们自己在课后补充了。把基础打好了，我相信后面的能够通过努力练习都能熟能生巧。另外，老师在课堂上还讲了很多活生生的例子，以期来警示我们不要为了让结构漂亮而忘记实验的初衷，结构上，最主要的还是要知道它的功能，不能做出来一张漂亮的图片，却不知道每个原子，基团代表什么，不能从图片上读到有用信息就是失败的图片。老师展示了一个同学的关于pymol viewer的PPT，我最喜欢上面的自己做的动画，相信自己也能摸索着做出来用于自己的课题，当然我会在理解其结构基础上再做这些工作。对于老师推荐的一些有用的网站，数据库和工具。比如phyre，protscale，dotlet，AAAAA抗体相关网站等等。每种工具都含蕴着很多有用的知识，作为科研人员，我们很多人以后都要走在行业的前列，我们有必要将自己武装到最好，不负所期。课程永远不会结束。我知道，接下来的学习中，我们会更加深刻理解自己的课题，这样会更好的利用课上所学知识应用到自己的课题上，不懂的地方，老师永远愿意帮助你。感谢罗老师。我会好好利用课上所学知识，服务于自己课题，做到真正掌握。

第二篇：实用生物信息技术课程期末总结

实用生物信息技术课程期末总结

北京大学生命科学学院 2012年8月1日

姓名_________学号____________电话____________ 座位号_____邮箱___________________ 得分______

（按学号为文件名保存为WORD 2003文档，如1001210241.DOC，8月20日前发送至pku12s@yahoo.cn）

简述你正在进行或准备开始的研究课题的研究背景和科学意义。通过文献阅读、数据库检索，利用序列分析、数据库搜索、结构分析和模拟等各种生物信息学工具，分析你研究课题涉及的蛋白质及其编码基因的序列特征，说明其可能的代谢通路和调控网络，分析或推测其可能的生物学功能；对不同物种中的直系同源基因和同一物种中的旁系同源基因进行系统发育分析，推断该基因家族的起源和演化。

 以上总结过程中可通过计算机网络进行交流，在交流基础上独立完成上述练习题，严禁互相抄袭。 引用文献资料，必须注明出处，严禁照抄网上现有资料。

第三篇：信息技术与生物课程的整合（定稿）

浅论信息技术与生物课程的整合

摘 要:随着新课改的的不断深入，信息技术与学科课程的整合是当前基础教育改革的一个新视点。在生物学科的教学中，新教材教学难度增加了，对教师的要求也更高了。生物教学课本中涉及的图、文、形、像很多，这要求学生在学习过程中发挥主观能动性，去看，去听，去想。信息技术可以化静为动，化抽象为直观，吸引学生注意，降低理解难度。信息技术与生物教学整合，可以创新教学模式，增大课堂容量，突出重点，解决难点，可以增强学生学习兴趣，提高教学效果，优化教学过程，培养学生能力。本文就信息技术与生物课程整合的本质、基本原则和途径、方法等做了一定的阐述。

关键词: 生物课程 信息技术 整合

一、信息技术与生物课程的整合的本质

信息技术与生物课程整合是信息时代课程教学改革的需要，是信息时代人才培养的需要，是提高生物学科教学效率的根本途径。以计算机为核心的信息技术作为新型教学媒体，当它们与生物课程加以整合，即与生物学科的教学进程密切结合时，它们可以体现出许多对于教育、教学过程来说极为宝贵的特性，从而为新型教学结构的创建提供最理想的教学环境。所以研究信息技术与生物课程整合的教学策略，具有重要实践指导意义。

所谓整合就是根据学科教学需要，充分发挥计算机的工具性功能，使计算机溶入学科教学中，从而提高教学质量，促进教学改革，培养具

有创造能力和创新精神的中学生。整合并非是将计算机与生物学科的简单结合，也并不能够解决生物教学中的所有问题，而是从实际出发，寻找最佳结合点，突出教学重点，解决难点，探索规律，启发思维，从而提高生物学科的教育教学质量。

二、信息技术与生物课程整合的基本原则

建构主义认为，知识不是通过教师传授得到，而是学习者在一定情境即社会文化背景下，借助他人（包括教师和学习伙伴）的帮助，利用必要的学习资料，通过意义建构的方式而获得。学习要以学生为中心，不仅要求学生由外部刺激的被动接受者和知识的灌输对象转变为信息加工的主体、知识意义的主动建构者，而且要求教师要由知识的传授者、灌输者变为学生主动建构意义的帮助者、促进者。

转化被动学习为主动学习，强调学生对知识的主动探索、主动发现和对所学知识意义的主动建构，而不是像传统教学那样，只是把知识从教师头脑中传送到学生的笔记本上，它强调的是“学”。在整个教学过程中，教师应利用情境、协作、会话等学习环境要素充分发挥学生的主动性、积极性和首创精神，最终使学生有效地实现对当前所学知识的意义建构。

教师要运用信息技术的多媒体技术等，为学生提供丰富的图、文、声等资料，创设一个生动的教学情境和一个自主的学习情境，激发学生学习生物知识的求知欲和好奇心。在教师精心设计的学习环境下，学生主动去收集并分析有关生物知识的信息和资料，对所学习的生物学问题

提出各种假设并努力加以验证，把当前学习内容尽量与自己已有的生物知识经验联系起来，最终达到当前所学的生物知识的意义建构的目的。由于建构主义所要求的学习环境得到了当代最新信息技术成果的强有力支持，所以成为信息技术与生物课程整合的理论基础。

三、信息技术与生物课程整合的途径、方法

如何将信息技术与生物学科进行有机的整合是关键问题。我日常教学设计的原则是：突出学生的主体地位，强调自主协作学习；分层次教学，面向全体学生，体现个性化学习，激励学生创新，培养锻炼学生的学习能力、利用信息技术的能力和科学创新精神。

在生物教学过程中，不但强调学生的认知主体作用，还要特别强调的是教师的引导和指导作用，强调师生互动。教师是学生意义建构的帮助者、促进者，教师应在可能的条件下，提出适当的问题以引起学生的思考和讨论，组织协作学习（开展讨论与交流），在讨论中设法把问题一步步引向深入，加深学生对所学知识内容的理解，并对协作学习过程进行引导，使之朝有利于学生意义建构的方向发展。

1、常用软件做为思维支持工具

思维支持工具不等于就是简单的课件制作工具。常规的计算机辅助教学往往要为一节课制作一个课件，课件使用的灵活性不大，而且在实施教学前要作大量的准备工作。其实计算机本身就具有强大的教学功能，如利用计算机中的图表工具进行数据统计，只要输入相应的数据，计算机在几秒钟之内便自动产生统计图，而且可以根据需要产生不同形式的统计图表。这样可以将更多的时间放在对数据变化趋势的分析推断上，培养学生的分析应用能力。实践表明，学生通过整合教学，既达到

了学会看统计图，能根据数据的变化做出适当的分析与推测；又达到了学会用图表工具制作统计图的信息技术教学目标；还激发了使用计算机的兴趣，大大提高了教学效率。

2、充分发挥计算机信息加工能力

强大的信息加工能力是计算机的一个重要特点。让学生对信息进行重整、加工和再应用，在大量信息中快速提取有用的信息，从而培养信息加工能力和流畅的表达能力，达到对大量知识的内化。学生在虚拟的网络中收集相关材料，包括文字、图片、动画等，然后根据学习目标进行信息筛选，并对选取的信息进行分析加工，再进行组合和再创造，最终得到学习成果，有的学生还把学习成果制作成网页的形式。在这里，计算机一方面在学生学习过程中扮演“信息工具”的角色，促使他们的信息素养得到提高，另一方面以“出版工具”的角色出现，帮助他们整理知识，综合应用所学的语文写作、美术绘画和欣赏等多项知识完成研究报告，使知识内化并激活。

3、创设模拟实验的整合教学

当今时代,是信息技术的高速发展的时代。新技术在教学中的应用更为学生的探索和学习提供了强有力的支持。许多在现实中很难做到的试验，可以通过计算机来模拟，从而给学生以真切感，促进学生掌握知识、发展能力。例如《减数分裂》一课，本节课所涉及到的知识较为抽象，虽然可以在显微镜下观察细胞分裂的装片，但在显微镜下看到的只是细胞分裂过程中的某一个时期的图形，而减数分裂本身是一个连续的动态的过程。为了让学生能更好地理解这一知识，并真正提高应用能力，在教学中可以利用计算机来进行模拟试验，设计制作减数分裂中“精子的形成”过程的多媒体课件，整个过程可控性强，让学生自己操作，体验“细胞连续分裂两次”的含义，帮助做出正确的理解。更为重要的是，通过整合，学生真切地认识到信息技术应用的重要性和学习方式革命的紧迫性。

4、使用网站开展研究性学习

在指教师在指导下，让学生开展研究性学习。从自身生活和社会生活中选择和确定研究专题，以类似科学研究的方式主动地获取知识、应用知识、解决问题。研究性学习的过程正是一个人际沟通与合作的过程。其目的是为了更好地培养学生信息收集和处理能力，发展创新精神，获得亲自参与研究探索的积极体验和提高沟通与合作能力。计算机网络技术为更好地开展研究性学习和实现协作式学习提供了良好的技术基础和支持环境。如：提供丰富的研究资源、创设生动的研究情境、大大地扩充协作范围，提高协作的效率、改革学习的方式。

遂然我在信息技术与学科教学整合的实验研究中进行了一些初步的尝试和探索，但是，信息技术与课程整合是一个漫长的、历尽艰辛的过程，只有通过我们教育工作者的全体参与和不懈努力，才能使我国的基础教育改革跃上一个新台阶。

参考文献：

[1]教育部．《中信息技术课程指导纲要（试行）》教育部文件，教基［2000］35号 [2]陆建身．生物教育展望[M]．上海：华东师范大学出版社，2001年11月

[3] 章剑卫．《信息技术与课程整合的研究与实践》，载《浙江教学研究》，2000年 [4]杨改学．现代教育技术教程[M]．甘肃：甘肃省教育出版社，2001年3月 [5]庞国斌,王冬凌．合作学习的理论与实践[M]．北京:开明出版社, 2001年5月 [6]何克抗．建构主义—革新传统教学的理论基础．北京:北京师范大学出版社，1998年

第四篇：生物校本课程总结

生物校本课程总结

苏鹏

本学期生物校本课程是《科学营养与健康》，采用学生自由选课的方式授课，选课学生为32人，固定教室是化学实验室，采用课件、讲授、视频图像的方式对学生进行指导。开设本课程的主要目的是让学生了解与生物学有关的课外知识，丰富学生的课余生活，提高学生学习生物的兴趣。授课方式相对比较轻松，为学生营造了相对宽松的学习环境，普遍受到学生的欢迎。涌现出了个别对生物非常感兴趣的学生，为以后进行常规生物学习奠定了基础。对涌现出来的个别对感兴趣的学生以后可以发展生物竞赛。

生物校本课程的主要内容：一是中学生的饮食营养，讲解学生普遍比较关注的问题。提倡健康的生活方式，现在中学生身体健康状况不是很好，与饮食和缺乏锻炼有很大关系。本课主要通过饮食方面的讲述，让学生养成良好的生活习惯。二是讲解流行病的预防及治疗，重在预防。这两部分内容学生比较感兴趣，开课情况较好，教师在讲授过程中，注意与学生的互动，打破教师的一言堂，参与学生的讨论。教师在开课过程中，多列举与现实生活密切联系的生活实例，提高学生学习兴趣。

授课方式的多样化，课件、讲授、视频、图像等形式，学生容易接受，相比较普通的授课方式，更加直观，内容多样化，教学手段也富有变化。开课地点主要在化学实验室，时间为每周三下午第三节。通过一节课的形式，让学生对本节的学习情况了解和掌握。时间虽然不是很长，但教师在课上主要是起引导作用，勾起学生学习兴趣，大部分时间仍然是在课后，学生的主动学习。

授课过程中存在的问题，部分学生在思想上仍然没有引起足够的重视，认为上校本课程就是放松，甚至极个别学生存在缺课情况，针对此种情况，我制定了上课点名的制度，即抽点。在一定程度上避免了部分学生上课产生的倦怠情况，通过学生上课的表现来给学生打分，促进了学生积极性的提高。

通过开设校本课程，让学生发现了学习生物学的另一面，不是枯燥的文字，难以理解的公式，原理。而是与生活密切相关的简单原理应用。开阔了学生的思维。

第五篇：生物实验课程总结

生物实验课程总结

谢天佑物理42 2014012228 这学期我总共完成了四个实验：啤酒与酸奶制作和微生物观察，ELISA实验，显微镜的使用与小白鼠腹腔血细胞的观察和蟾蜍解刨实验。

啤酒与酸奶制作和微生物观察：

这个实验让我学会了制作酸奶的具体流程，还有制作啤酒的流程。并且让我了解到我们周边的微生物竟然是如此之多。

ELISA实验：

本实验让我们学习了酶相互反应失活的现象，然后用硫酸和显色溶剂让我们观察到反应液浓度引起的显色梯度。收获是让我们感受到酶的剂量可以如此小，而作用是如此之明显。

显微镜的使用与小白鼠腹腔血细胞的观察：

这个实验使用的是双目显微镜，十分新鲜。我以前从来没有接触过如此强大的显微镜。并且我还把所有的切片标本进行了一遍观察。发现了我们周边世界竟然有如此多的微观结构，可是我们的肉眼竟然看不见！我们看见的确是我们视觉的分辨率所致的平均效果。并且我观察了肌肉细胞，神经细胞，鱼鳞细胞等等。而他们的结构更是神奇。后面还观察了小鼠腹腔的腹腔血细胞。不过解刨小鼠的过程还是会很有心里负担的，不过后来在解刨蟾蜍实验听了生物伦理后心里感觉好多了。

蟾蜍解刨实验：

该实验就让我对解刨生物不再产生自卑感。并且了解并学会识别了生物的内脏等器官。其中包括心脏，肺腔，胃，卵巢，大肠，小肠，淋巴结等内脏结构。

总结：

整个生物实验的学习给了我很多的体验。让我了解了微观的生物们的活泼运动。了解生物身体里面的复杂结构，这一次是真正的看见，以前的听闻只能说是唯象的理论。学习使用显微镜，学习使用很多的不曾接触的仪器。并且让我明白了生物伦理是多么的重要，我不能做出违背自己良心底线的东西。杀害小动物后也要给她们建立一个墓碑。这样以缅怀她们对科学的献身。敬!