基因的mRNA序列的查找方法

第一篇：基因的mRNA序列的查找方法

mRNA1

Homo sapiens cytotoxic T-lymphocyte-associated protein 4(CTLA4), transcript variant 1, mRNA

NCBI Reference Sequence: NM_005214.4

FASTA Graphics Go to: LOCUS

NM_005214

2033 bp

mRNA

linear

PRI 01-APR-2012 DEFINITION Homo sapiens cytotoxic T-lymphocyte-associated protein 4(CTLA4)，transcript variant 1, mRNA.ACCESSION

NM_005214 XM_001129541 XM_001129550 XM_001129561 VERSION

NM_005214.4 GI:339276048 KEYWORDS

.SOURCE

Homo sapiens(human)

ORGANISM Homo sapiens

Eukaryota;Metazoa;Chordata;Craniata;Vertebrata;Euteleostomi;

Mammalia;Eutheria;Euarchontoglires;Primates;Haplorrhini;

Catarrhini;Hominidae;Homo.REFERENCE(bases 1 to 2033)

AUTHORS

Ryden,A., Bolmeson,C., Jonson,C.O., Cilio,C.M.and Faresjo,M.TITLE

Low expression and secretion of circulating soluble CTLA-4 in

peripheral blood mononuclear cells and sera from type 1 diabetic

children

JOURNAL

Diabetes Metab.Res.Rev.28(1), 84-96(2012)

PUBMED

22218756

REMARK

GeneRIF: Low protein concentrations of circulating soluble CTLA-4

and a positive correlation between soluble CTLA-4 mRNA and protein

were seen in IDDM, in parallel with a negative correlation in

healthy subjects REFERENCE(bases 1 to 2033)

AUTHORS

Rabe,H., Lundell,A.C., Andersson,K., Adlerberth,I., Wold,A.E.and

Rudin,A.TITLE

Higher proportions of circulating FOXP3+ and CTLA-4+ regulatory T

cells are associated with lower fractions of memory CD4+ T cells in

infants

JOURNAL

J.Leukoc.Biol.90(6), 1133-1140(2011)

PUBMED

21934066

REMARK

GeneRIF: FOXP3+ or CTLA-4+ regulatory T cells may modulate CD4+ T

cell activation and homing receptor expression in children.REFERENCE(bases 1 to 2033)

AUTHORS

Olive,D., le Thi,S., Xerri,L., Hirsch,I.and Nunes,J.A.TITLE

[The role of co-inhibitory signals driven by CTLA-4 in immune

system]

JOURNAL

Med Sci(Paris)27(10), 842-849(2011)

PUBMED

22027421

REMARK

GeneRIF: The role of CTLA4 as an inhibitory co-signaling molecule

in activated T lymphocytes is reviewed.Review.REFERENCE(bases 1 to 2033)

AUTHORS

Kimkong,I., Nakkuntod,J., Sae-Ngow,S., Snabboon,T., Avihingsanon,Y.and Hirankarn,N.TITLE

Association between CTLA-4 polymorphisms and the susceptibility to

systemic lupus erythematosus and Graves' disease in Thai population

JOURNAL

Asian Pac.J.Allergy Immunol.29(3), 229-235(2011)

PUBMED

22053592

REMARK

GeneRIF: No association between two functional polymorphisms

(+49A/G and CT60A/G)of the CTLA-4 gene and susceptibility to

systemic lupus erythematosus and Graves' disease.REFERENCE(bases 1 to 2033)

AUTHORS

Oaks,M.K., Hallett,K.M., Penwell,R.T., Stauber,E.C., Warren,S.J.and Tector,A.J.TITLE

A native soluble form of CTLA-4

JOURNAL

Cell.Immunol.201(2), 144-153(2000)

PUBMED

10831323 REFERENCE(bases 1 to 2033)

AUTHORS

Magistrelli,G., Jeannin,P., Herbault,N., Benoit De Coignac,A.，Gauchat,J.F., Bonnefoy,J.Y.and Delneste,Y.TITLE

A soluble form of CTLA-4 generated by alternative splicing is

expressed by nonstimulated human T cells

JOURNAL

Eur.J.Immunol.29(11), 3596-3602(1999)

PUBMED

10556814 REFERENCE(bases 1 to 2033)

AUTHORS

Chen,C., Gault,A., Shen,L.and Nabavi,N.TITLE

Molecular cloning and expression of early T cell costimulatory

molecule-1 and its characterization as B7-2 molecule

JOURNAL

J.Immunol.152(10), 4929-4936(1994)

PUBMED

7513726 REFERENCE(bases 1 to 2033)

AUTHORS

Linsley,P.S., Brady,W., Urnes,M., Grosmaire,L.S., Damle,N.K.and

Ledbetter,J.A.TITLE

CTLA-4 is a second receptor for the B cell activation antigen B7

JOURNAL

J.Exp.Med.174(3), 561-569(1991)

PUBMED

1714933 REFERENCE(bases 1 to 2033)

AUTHORS

Harper,K., Balzano,C., Rouvier,E., Mattei,M.G., Luciani,M.F.and

Golstein,P.TITLE

CTLA-4 and CD28 activated lymphocyte molecules are closely related

in both mouse and human as to sequence, message expression, gene

structure, and chromosomal location

JOURNAL

J.Immunol.147(3), 1037-1044(1991)

PUBMED

1713603 REFERENCE(bases 1 to 2033)

AUTHORS

Dariavach,P., Mattei,M.G., Golstein,P.and Lefranc,M.P.TITLE

Human Ig superfamily CTLA-4 gene: chromosomal localization and

identity of protein sequence between murine and human CTLA-4

cytoplasmic domains

JOURNAL

Eur.J.Immunol.18(12), 1901-1905(1988)

PUBMED

3220103 COMMENT

REVIEWED REFSEQ: This record has been curated by NCBI staff.The

reference sequence was derived from AF414120.1 and AC010138.6.This sequence is a reference standard in the RefSeqGene project.On Jul 2, 2011 this sequence version replaced gi:83700229.Publication Note: This RefSeq record includes a subset of the

publications that are available for this gene.Please see the Gene

record to access additional publications.Summary: This gene is a member of the immunoglobulin superfamily

and encodes a protein which transmits an inhibitory signal to T

cells.The protein contains a V domain, a transmembrane domain, and

a cytoplasmic tail.Alternate transcriptional splice variants，encoding different isoforms, have been characterized.The

membrane-bound isoform functions as a homodimer interconnected by a

disulfide bond, while the soluble isoform functions as a monomer.Mutations in this gene have been associated with insulin-dependent

diabetes mellitus, Graves disease, Hashimoto thyroiditis, celiac

disease, systemic lupus erythematosus, thyroid-associated

orbitopathy, and other autoimmune diseases.[provided by RefSeq，Jul 2008].Transcript Variant: This variant(1)represents the longer

transcript and encodes the longer membrane-bound isoform CTLA4-TM.COMPLETENESS: complete on the 3' end.PRIMARY

REFSEQ_SPAN

PRIMARY_IDENTIFIER PRIMARY_SPAN

1-1390

AF414120.1

1-1390

1391-1398

AC010138.6

103850-103857

1399-2033

AF414120.1

1391-2025 FEATURES

Location/Qualifiers

source

1..2033

/organism=“Homo sapiens”

/mol_type=“mRNA”

/db_xref=“taxon:9606”

COMP

/chromosome=“2”

/map=“2q33”

gene

1..2033

/gene=“CTLA4”

/gene_synonym=“CD;CD152;CELIAC3;CTLA-4;GRD4;GSE;

ICOS;IDDM12”

/note=“cytotoxic T-lymphocyte-associated protein 4”

/db_xref=“GeneID:1493”

/db_xref=“HGNC:2505”

/db_xref=“HPRD:00474”

/db_xref=“MIM:123890”

exon

1..264

/gene=“CTLA4”

/gene_synonym=“CD;CD152;CELIAC3;CTLA-4;GRD4;GSE;

ICOS;IDDM12”

/inference=“alignment:Splign:1.39.8”

/number=1

STS

61..1019

/gene=“CTLA4”

/gene_synonym=“CD;CD152;CELIAC3;CTLA-4;GRD4;GSE;

ICOS;IDDM12”

/db_xref=“UniSTS:481662”

STS

125..877

/gene=“CTLA4”

/gene_synonym=“CD;CD152;CELIAC3;CTLA-4;GRD4;GSE;

ICOS;IDDM12”

/db_xref=“UniSTS:482061”

misc_feature

126..128

/gene=“CTLA4”

/gene_synonym=“CD;CD152;CELIAC3;CTLA-4;GRD4;GSE;

ICOS;IDDM12”

/note=“upstream in-frame stop codon”

CDS

156..827

/gene=“CTLA4”

/gene_synonym=“CD;CD152;CELIAC3;CTLA-4;GRD4;GSE;

ICOS;IDDM12”

/note=“isoform CTLA4-TM precursor is encoded by transcript

variant 1;celiac disease 3;cytotoxic

T-lymphocyte-associated serine esterase-4;cytotoxic

T-lymphocyte-associated antigen 4;cytotoxic T-lymphocyte

protein 4;ligand and transmembrane spliced cytotoxic T

lymphocyte associated antigen 4;cytotoxic T-lymphocyte

antigen 4;CD152 isoform;cytotoxic T lymphocyte

associated antigen 4 short spliced form”

/codon_start=1

/product=“cytotoxic T-lymphocyte protein 4 isoform

CTLA4-TM precursor”

/protein_id=“NP_005205.2”

/db_xref=“GI:21361212”

/db_xref=“CCDS:CCDS2362.1”

/db_xref=“GeneID:1493”

/db_xref=“HGNC:2505”

/db_xref=“HPRD:00474”

/db_xref=“MIM:123890”

/translation=“MACLGFQRHKAQLNLATRTWPCTLLFFLLFIPVFCKAMHVAQPA

VVLASSRGIASFVCEYASPGKATEVRVTVLRQADSQVTEVCAATYMMGNELTFLDDSI

CTGTSSGNQVNLTIQGLRAMDTGLYICKVELMYPPPYYLGIGNGTQIYVIDPEPCPDS

DFLLWILAAVSSGLFFYSFLLTAVSLSKMLKKRSPLTTGVYVKMPPTEPECEKQFQPY

FIPIN”

sig_peptide

156..260

/gene=“CTLA4”

/gene_synonym=“CD;CD152;CELIAC3;CTLA-4;GRD4;GSE;

ICOS;IDDM12”

mat_peptide

261..824

/gene=“CTLA4”

/gene_synonym=“CD;CD152;CELIAC3;CTLA-4;GRD4;GSE;

ICOS;IDDM12”

/product=“cytotoxic T-lymphocyte protein 4 isoform

CTLA4-TM”

misc_feature

291..305

/gene=“CTLA4”

/gene_synonym=“CD;CD152;CELIAC3;CTLA-4;GRD4;GSE;

ICOS;IDDM12”

/experiment=“experimental evidence, no additional details

recorded”

/note=“propagated from UniProtKB/Swiss-Prot(P16410.3);

Region: Homodimerization”

misc_feature

603..620

/gene=“CTLA4”

/gene_synonym=“CD;CD152;CELIAC3;CTLA-4;GRD4;GSE;

ICOS;IDDM12”

/experiment=“experimental evidence, no additional details

recorded”

/note=“propagated from UniProtKB/Swiss-Prot(P16410.3);

Region: Homodimerization”

misc_feature

639..701

/gene=“CTLA4”

/gene_synonym=“CD;CD152;CELIAC3;CTLA-4;GRD4;GSE;

ICOS;IDDM12”

/inference=“non-experimental evidence, no additional

details recorded”

/note=“propagated from UniProtKB/Swiss-Prot(P16410.3);

transmembrane region”

misc_feature

756..758

/gene=“CTLA4”

/gene_synonym=“CD;CD152;CELIAC3;CTLA-4;GRD4;GSE;

ICOS;IDDM12”

/experiment=“experimental evidence, no additional details

recorded”

/note=“Phosphotyrosine, by TXK;propagated from

UniProtKB/Swiss-Prot(P16410.3);phosphorylation site”

exon

265..612

/gene=“CTLA4”

/gene_synonym=“CD;CD152;CELIAC3;CTLA-4;GRD4;GSE;

ICOS;IDDM12”

/inference=“alignment:Splign:1.39.8”

/number=2

exon

613..722

/gene=“CTLA4”

/gene_synonym=“CD;CD152;CELIAC3;CTLA-4;GRD4;GSE;

ICOS;IDDM12”

/inference=“alignment:Splign:1.39.8”

/number=3

exon

723..1975

/gene=“CTLA4”

/gene_synonym=“CD;CD152;CELIAC3;CTLA-4;GRD4;GSE;

ICOS;IDDM12”

/inference=“alignment:Splign:1.39.8”

/number=4

STS

855..1041

/gene=“CTLA4”

/gene_synonym=“CD;CD152;CELIAC3;CTLA-4;GRD4;GSE;

ICOS;IDDM12”

/standard_name=“STS-M37245”

/db_xref=“UniSTS:21475”

STS

1309..1436

/gene=“CTLA4”

/gene_synonym=“CD;CD152;CELIAC3;CTLA-4;GRD4;GSE;

ICOS;IDDM12”

/standard_name=“GDB:180415”

/db_xref=“UniSTS:48500”

polyA_signal

1951..1956

/gene=“CTLA4”

/gene_synonym=“CD;CD152;CELIAC3;CTLA-4;GRD4;GSE;

ICOS;IDDM12”

polyA_site

1975

/gene=“CTLA4”

/gene_synonym=“CD;CD152;CELIAC3;CTLA-4;GRD4;GSE;

ICOS;IDDM12” ORIGIN cttctgtgtg tgcacatgtg taatacatat ctgggatcaa agctatctat ataaagtcct

tgattctgtg tgggttcaaa cacatttcaa agcttcagga tcctgaaagg ttttgctcta

cttcctgaag acctgaacac cgctcccata aagccatggc ttgccttgga tttcagcggc

181 acaaggctca gctgaacctg gctaccagga cctggccctg cactctcctg ttttttcttc

241 tcttcatccc tgtcttctgc aaagcaatgc acgtggccca gcctgctgtg gtactggcca

301 gcagccgagg catcgccagc tttgtgtgtg agtatgcatc tccaggcaaa gccactgagg

361 tccgggtgac agtgcttcgg caggctgaca gccaggtgac tgaagtctgt gcggcaacct

421 acatgatggg gaatgagttg accttcctag atgattccat ctgcacgggc acctccagtg

481 gaaatcaagt gaacctcact atccaaggac tgagggccat ggacacggga ctctacatct

541 gcaaggtgga gctcatgtac ccaccgccat actacctggg cataggcaac ggaacccaga

601 tttatgtaat tgatccagaa ccgtgcccag attctgactt cctcctctgg atccttgcag

661 cagttagttc ggggttgttt ttttatagct ttctcctcac agctgtttct ttgagcaaaa

721 tgctaaagaa aagaagccct cttacaacag gggtctatgt gaaaatgccc ccaacagagc

781 cagaatgtga aaagcaattt cagccttatt ttattcccat caattgagaa accattatga

841 agaagagagt ccatatttca atttccaaga gctgaggcaa ttctaacttt tttgctatcc

901 agctattttt atttgtttgt gcatttgggg ggaattcatc tctctttaat ataaagttgg

961 atgcggaacc caaattacgt gtactacaat ttaaagcaaa ggagtagaaa gacagagctg

1021 ggatgtttct gtcacatcag ctccactttc agtgaaagca tcacttggga ttaatatggg

1081 gatgcagcat tatgatgtgg gtcaaggaat taagttaggg aatggcacag cccaaagaag

1141 gaaaaggcag ggagcgaggg agaagactat attgtacaca ccttatattt acgtatgaga

1201 cgtttatagc cgaaatgatc ttttcaagtt aaattttatg ccttttattt cttaaacaaa

1261 tgtatgatta catcaaggct tcaaaaatac tcacatggct atgttttagc cagtgatgct

1321 aaaggttgta ttgcatatat acatatatat atatatatat atatatatat atatatatat

1381 atatatatat atatatattt taatttgata gtattgtgca tagagccacg tatgtttttg

1441 tgtatttgtt aatggtttga atataaacac tatatggcag tgtctttcca ccttgggtcc

1501 cagggaagtt ttgtggagga gctcaggaca ctaatacacc aggtagaaca caaggtcatt

1561 tgctaactag cttggaaact ggatgaggtc atagcagtgc ttgattgcgt ggaattgtgc

1621 tgagttggtg ttgacatgtg ctttggggct tttacaccag ttcctttcaa tggtttgcaa

1681 ggaagccaca gctggtggta tctgagttga cttgacagaa cactgtcttg aagacaatgg

1741 cttactccag gagacccaca ggtatgacct tctaggaagc tccagttcga tgggcccaat

1801 tcttacaaac atgtggttaa tgccatggac agaagaaggc agcaggtggc agaatggggt

1861 gcatgaaggt ttctgaaaat taacactgct tgtgttttta actcaatatt ttccatgaaa

1921 atgcaacaac atgtataata tttttaatta aataaaaatc tgtggtggtc gttttaaaaa

1981 aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaa

Homo sapiens cytotoxic T-lymphocyte-associated protein 4(CTLA4), transcript variant 2, mRNA NCBI Reference Sequence: NM_001037631.2 FASTA Graphics

Go to:

LOCUS NM_001037631 1923 bp mRNA linear PRI 01-APR-2012 DEFINITION Homo sapiens cytotoxic T-lymphocyte-associated protein 4(CTLA4), transcript variant 2, mRNA.ACCESSION NM_001037631 VERSION NM_001037631.2 GI:339276050 KEYWORDS.SOURCE Homo sapiens(human)ORGANISM Homo sapiens

Eukaryota;Metazoa;Chordata;Craniata;Vertebrata;Euteleostomi;Mammalia;Eutheria;Euarchontoglires;Primates;Haplorrhini;Catarrhini;Hominidae;Homo.REFERENCE 1(bases 1 to 1923)AUTHORS Ryden,A., Bolmeson,C., Jonson,C.O., Cilio,C.M.and Faresjo,M.TITLE Low expression and secretion of circulating soluble CTLA-4 in peripheral blood mononuclear cells and sera from type 1 diabetic children JOURNAL Diabetes Metab.Res.Rev.28(1), 84-96(2012)PUBMED 22218756

REMARK GeneRIF: Low protein concentrations of circulating soluble CTLA-4 and a positive correlation between soluble CTLA-4 mRNA and protein were seen in IDDM, in parallel with a negative correlation in healthy subjects REFERENCE 2(bases 1 to 1923)AUTHORS Rabe,H., Lundell,A.C., Andersson,K., Adlerberth,I., Wold,A.E.and Rudin,A.TITLE Higher proportions of circulating FOXP3+ and CTLA-4+ regulatory T cells are associated with lower fractions of memory CD4+ T cells in infants JOURNAL J.Leukoc.Biol.90(6), 1133-1140(2011)

PUBMED 21934066

REMARK GeneRIF: FOXP3+ or CTLA-4+ regulatory T cells may modulate CD4+ T cell activation and homing receptor expression in children.REFERENCE 3(bases 1 to 1923)AUTHORS Olive,D., le Thi,S., Xerri,L., Hirsch,I.and Nunes,J.A.TITLE [The role of co-inhibitory signals driven by CTLA-4 in immune system] JOURNAL Med Sci(Paris)27(10), 842-849(2011)PUBMED 22027421

REMARK GeneRIF: The role of CTLA4 as an inhibitory co-signaling molecule in activated T lymphocytes is reviewed.Review.REFERENCE 4(bases 1 to 1923)AUTHORS Kimkong,I., Nakkuntod,J., Sae-Ngow,S., Snabboon,T., Avihingsanon,Y.and Hirankarn,N.TITLE Association between CTLA-4 polymorphisms and the susceptibility to systemic lupus erythematosus and Graves' disease in Thai population JOURNAL Asian Pac.J.Allergy Immunol.29(3), 229-235(2011)PUBMED REMARK GeneRIF: No association between two functional polymorphisms(+49A/G and CT60A/G)of the CTLA-4 gene and susceptibility to systemic lupus erythematosus and Graves' disease.REFERENCE 5(bases 1 to 1923)AUTHORS Oaks,M.K., Hallett,K.M., Penwell,R.T., Stauber,E.C., Warren,S.J.and Tector,A.J.TITLE A native soluble form of CTLA-4 JOURNAL Cell.Immunol.201(2), 144-153(2000)PUBMED REFERENCE 6(bases 1 to 1923)AUTHORS Magistrelli,G., Jeannin,P., Herbault,N., Benoit De Coignac,A., Gauchat,J.F., Bonnefoy,J.Y.and Delneste,Y.TITLE A soluble form of CTLA-4 generated by alternative splicing is expressed by nonstimulated human T cells JOURNAL Eur.J.Immunol.29(11), 3596-3602(1999)PUBMED REFERENCE 7(bases 1 to 1923)AUTHORS Chen,C., Gault,A., Shen,L.and Nabavi,N.TITLE Molecular cloning and expression of early T cell costimulatory molecule-1 and its characterization as B7-2 molecule JOURNAL J.Immunol.152(10), 4929-4936(1994)PUBMED REFERENCE 8(bases 1 to 1923)AUTHORS Linsley,P.S., Brady,W., Urnes,M., Grosmaire,L.S., Damle,N.K.and Ledbetter,J.A.TITLE CTLA-4 is a second receptor for the B cell activation antigen B7 22053592

10831323

10556814

7513726

JOURNAL J.Exp.Med.174(3), 561-569(1991)PUBMED 1714933

REFERENCE 9(bases 1 to 1923)AUTHORS Harper,K., Balzano,C., Rouvier,E., Mattei,M.G., Luciani,M.F.and Golstein,P.TITLE CTLA-4 and CD28 activated lymphocyte molecules are closely related in both mouse and human as to sequence, message expression, gene structure, and chromosomal location JOURNAL J.Immunol.147(3), 1037-1044(1991)PUBMED REFERENCE 10(bases 1 to 1923)AUTHORS Dariavach,P., Mattei,M.G., Golstein,P.and Lefranc,M.P.TITLE Human Ig superfamily CTLA-4 gene: chromosomal localization and identity of protein sequence between murine and human CTLA-4 cytoplasmic domains JOURNAL Eur.J.Immunol.18(12), 1901-1905(1988)PUBMED COMMENT REVIEWED reference sequence was derived from On Jul 2, 2011 this sequence version replaced gi:

Publication Note: This RefSeq record includes a subset of the publications that are available for this gene.Please see the Gene record to access additional publications.Summary: This gene is a member of the immunoglobulin superfamily and encodes a protein which transmits an inhibitory signal to T cells.The protein contains a V domain, a transmembrane domain, and a cytoplasmic tail.Alternate transcriptional splice variants, encoding different isoforms, have been characterized.The membrane-bound isoform functions as a homodimer interconnected by a disulfide bond, while the soluble isoform functions as a monomer.Mutations in this gene have been associated with insulin-dependent diabetes mellitus, Graves disease, Hashimoto thyroiditis, celiac disease, systemic lupus erythematosus, thyroid-associated orbitopathy, and other autoimmune diseases.[provided by RefSeq, Jul 2008].Transcript Variant: This variant(2)lacks an exon in the coding region, which results in a frameshift and an early stop codon, compared to variant 1.The encoded isoform CTLA-4delTM(also known as sCTLA4)is soluble and lacks the transmembrane domain, compared to isoform a.The exon skip represented in this variant is is based on human U90273.1, and is consistent with mouse U90270.1 and 1713603

3220103

REFSEQ: This record has been curated by NCBI staff.The AF414120.1 and AC010138.6.83700230.the data published in PMID:10831323 and PMID:10556814.CCDS Note: This CCDS representation is based on U90273.1 and on full-length RT-PCR evidence from PMIDs 10831323 and 10556814.This variant also has homology support from cow AF539438.1, mouse U90270.1 and rat U90271.1.COMPLETENESS: complete on the 3' end.PRIMARY REFSEQ_SPAN PRIMARY_IDENTIFIER PRIMARY_SPAN COMP 1-612 AF414120.1 1-612 613-1280 AF414120.1 723-1390 1281-1288 AC010138.6 103850-103857 1289-1923 AF414120.1 1391-2025 FEATURES Location/Qualifiers source 1..1923 /organism=“Homo sapiens” /mol_type=“mRNA” /db_xref=“taxon:9606” /chromosome=“2” /map=“2q33” gene 1..1923 /gene=“CTLA4” /gene_synonym=“CD;CD152;CELIAC3;CTLA-4;GRD4;GSE;ICOS;IDDM12” /note=“cytotoxic T-lymphocyte-associated protein 4” /db_xref=“GeneID:1493” /db_xref=“HGNC:2505” /db_xref=“MIM:123890” exon 1..264 /gene=“CTLA4” /gene_synonym=“CD;CD152;CELIAC3;CTLA-4;GRD4;GSE;ICOS;IDDM12” /inference=“alignment:Splign:1.39.8” /number=1 STS 61..909 /gene=“CTLA4” /gene_synonym=“CD;CD152;CELIAC3;CTLA-4;GRD4;GSE;ICOS;IDDM12” /db_xref=“UniSTS:481662” STS 125..767 /gene=“CTLA4” /gene_synonym=“CD;CD152;CELIAC3;CTLA-4;GRD4;GSE;ICOS;IDDM12” /db_xref=“UniSTS:482061” misc_feature 126..128

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NP_001032720.1” CCDS42803.1“ 1493” 2505“ 123890” 156..260 261..677

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961 ttaatatggg gatgcagcat tatgatgtgg gtcaaggaat taagttaggg aatggcacag 1021 cccaaagaag gaaaaggcag ggagcgaggg agaagactat attgtacaca ccttatattt 1081 acgtatgaga cgtttatagc cgaaatgatc ttttcaagtt aaattttatg ccttttattt 1141 cttaaacaaa tgtatgatta catcaaggct tcaaaaatac tcacatggct atgttttagc 1201 cagtgatgct aaaggttgta ttgcatatat acatatatat atatatatat atatatatat 1261 atatatatat atatatatat atatatattt taatttgata gtattgtgca tagagccacg 1321 tatgtttttg tgtatttgtt aatggtttga atataaacac tatatggcag tgtctttcca 1381 ccttgggtcc cagggaagtt ttgtggagga gctcaggaca ctaatacacc aggtagaaca 1441 caaggtcatt tgctaactag cttggaaact ggatgaggtc atagcagtgc ttgattgcgt 1501 ggaattgtgc tgagttggtg ttgacatgtg ctttggggct tttacaccag ttcctttcaa 1561 tggtttgcaa ggaagccaca gctggtggta tctgagttga cttgacagaa cactgtcttg 1621 aagacaatgg cttactccag gagacccaca ggtatgacct tctaggaagc tccagttcga 1681 tgggcccaat tcttacaaac atgtggttaa tgccatggac agaagaaggc agcaggtggc 1741 agaatggggt gcatgaaggt ttctgaaaat taacactgct tgtgttttta actcaatatt 1801 ttccatgaaa atgcaacaac atgtataata tttttaatta aataaaaatc tgtggtggtc 1861 gttttaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1921 aaa

第二篇：工程造价信息查找方法

经过长时间收集，在淘宝上发现以下地区造价信息。

需要的，可以直接在淘宝上买的，直接搜索“地区+造价信息”例如：杭州造价信息 造价信息地区有：

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第三篇：‘黄花梨’2个?CYP707A?基因的克隆和序列分析

龙源期刊网 http://www.xiexiebang.com：8004/）获得同源序列；将同源序列返回到NCBI网站在线blast验证；而后以梨基因组CDS数据库得到的2条序列为参照，设计引物。PCR反应体系25 μl（模板1 μl，10 μmol/μl上游引物1 μl，10 μmol/μl下游引物1 μl，10 mmol/L dNTP mixture 1 μl，10×ExTaq Buffer 2.5 μl，5 U/μl EXTaq 0.15 μl，ddH2O 1835 μl），目的基因扩增引物见表1。以„黄花梨‟花芽总RNA逆转录成的cDNA为模板进行PCR扩增。反应程序：94 ℃预热5 min；94 ℃变性45 s，48～55 ℃退火45 s，72 ℃延伸1.5 min；共35个循环，最后72 ℃延伸10 min；4 ℃保存。凝胶电泳检测PCR扩增产物（图1），并切下1 400 bp左右的目的条带，经胶回收（EasyPure Quick Gel Extraction Kit，北京全式金有限公司，中国北京）纯化，连接到PMD18T（Takara，中国大连）上，后转化到DH5α大肠杆菌感受态细胞中，在AMP培养基培养大肠杆菌，将菌液PCR鉴定的阳性克隆送至英潍捷基贸易有限公司（中国上海）测序。2 结果与分析

2.1 „黄花梨‟CYP707A基因的克隆从„黄花梨‟花芽上克隆得到2个CYP707A基因序列，通过DNAMAN比对，发现两者之间的相似性高达94.27%（图2），氨基酸相似性94.96%。为此，从梨基因组数据库找到2个基因的内含子和外显子基因组序列进行比对，结果显示其相似性为69.95%，说明这2个CYP707A基因为相似性较高的不同基因。将克隆到的„黄花梨‟CYP707A 基因分别定名为PpCYP707A4（Genbank登录号：KP279630）、PpCYP707A5（Genbank登录号：KP279631）。

PpCYP707A4的CDS序列全长为1 431 bp，编码476个氨基酸；其氨基酸序列与苹果（Malus domestica XP_008346457.1）相似性97%，与碧桃（Prunus persica XP_007210577.1）

龙源期刊网 http://www.xiexiebang.com 相似性90%，与梅（Prunus mume XP_008245093.1）相似性87%，与草莓（Fragaria vesca subsp.Vesca XP_004300683.1）相似性83%，与甜橙（Citrus sinensis NP_001275876.1）相似性84%。

安徽农业科学2015年PpCYP707A5的CDS序列全长为1 425 bp，编码474个氨基酸；其氨基酸序列与苹果（Malus domestica XP_008382035.1）相似性 97%，与碧桃（Prunus persica XP_007210577.1）相似性89%，与梅（Prunus mume XP_008245093.1）相似性86%，与草莓（Fragaria vesca subsp.Vesca XP_004300683.1）相似性84%，与甜橙（Citrus sinensis NP_001275876.1）相似性85%。

在线blastp分析，2个PpCYP707As基因均具有1个保守结构域，为PLN02196（图3），属于P450超基因家族。以PpCYP707A4和PpCYP707A5的氨基酸序列作为参考，从NCBI数据库上blast其他物种的CYP707A氨基酸序列，构建系统发育树。仅苹果blast到2个基因（XP_008346457.1、XP_008382035.1），其他物种均只blast到1个基因。系统发育树分析显示（图4），蔷薇科植物的CYP707A基因聚为一大支，PpCYP707A4与苹果XP_008346457.1基因，PpCYP707A5与苹果XP_008382035.1基因单独聚类。

注：a.„黄花梨‟总RNA； b.PpCYP707A4 PCR扩增； c.PpCYP707A5 PCR扩增。

图1电泳图谱图22个PpCYP707As的核苷酸序列比对注：a.PpCYP707A4蛋白的保守结构域； PpCYP707A5蛋白的保守结构域。

图3蛋白保守结构域图42个PpCY707As系统进化树2.2蛋白性质预测采用ExPASy ProtParam、TMpred、SignalP 4.1预测蛋白性质和Prot预测亚细胞定位，结果显示，PpCYP707A4蛋白的理论分子质量为54.4 kDa，理论等电点为9.01，不稳定系数为48.48，属于不稳定蛋白，分子式可写为C2493H3901N645O679S20，原子数7 338，带负电荷（Asp + Glu）氨基酸50，带正电荷（Arg + Lys）氨基酸59，脂溶系数为9239，GRAVY为-0.100，是亲水性蛋白；在6～23位点含有一个由内向外的跨膜螺旋结构，8～26位点有一个由外向内的跨膜螺旋结构；不含信号肽，为非分泌蛋白；并定位在内质网，概率为0.820。PpCYP707A5蛋白的理论分子质量为54.1 kDa，理论等电点为9.03，不稳定系数为47.78，属于不稳定蛋白，分子式可写为C2481H3874N640O673S21，原子数7 689，带负电荷（Asp + Glu）氨基酸49，带正电荷（Arg + Lys）氨基酸59，脂溶系数为91.96，GRAVY为-0.089，是亲水性蛋白。在6～23位点含有一个由内向外的跨膜螺旋结构，8～27位点有一个由外向内的跨膜螺旋结构。与PpCYP707A4蛋白相同，也不含信号肽，为非分泌蛋白；定位在内质网，概率为0.820。

2.3蛋白结构预测采用Npsa-pbil、NetPhos 2.0 Server在线工具预测蛋白质二级结构、磷酸化位点。PpCYP707A4有243个氨基酸残基形成α-螺旋，32个形成β-螺旋，78个形成延伸链和132个形成无规则卷曲；有12个丝氨酸（serine，S）残基、7个苏氨酸残基（threonine，龙源期刊网 http://www.xiexiebang.com T），2个酪氨酸（tyrosine，Y）参与磷酸化过程。PpCYP707A5有226个氨基酸残基形成α-螺旋，27个形成β-螺旋，81个形成延伸链和140个形成无规则卷曲；有13个丝氨酸（serine，S）残基、6个苏氨酸残基（threonine，T），3个酪氨酸（tyrosine，Y）参与磷酸化过程。Swiss-model预测蛋白三级结构，结果显示PpCYP707A4、PpCYP707A5蛋白的QMEAN4值分别为-5.67、-4.79，三级结构存在较大差异（图5）。

注：a.PpCYP707A4蛋白三级结构； b.PpCYP707A5蛋白三级结构。

图5预测的2个PpCYP707A蛋白三级结构3 讨论

休眠的长短决定落叶果树的地理分布，是落叶果树的重要性状之一[7]。我国梨的种质资源大体分为北方品种群和南方品种群，北方品种群的特点为抗寒力较强、休眠期较长，南方品种群表现出早熟、休眠期短等优势[8]。„黄花梨‟在福建省建宁县能够正常开花结果，产量较大，而在纬度较低的福建省上杭县其萌芽不整齐的现象明显，休眠期的长短对于„黄花梨‟的产量和栽培具有重要的制约作用，休眠影响梨品种的选育和梨产业的发展，研究梨的休眠意义重大。对桃[3]、大樱桃[9-10]、欧洲甜樱桃[11]、葡萄[12]、牡丹[13]等的研究表明ABA的含量变化是影响木本植物芽休眠进程的重要因素。从分子水平探讨ABA调控梨花芽休眠进程的分子机制，将有利于构建梨休眠的调控网络，从而有助于梨品种的选育。

该研究从„黄花梨‟上分离到ABA分解途径关键酶基因PpCYP707A4和PpCYP707A5，采用生物信息学方法分析其核苷酸序列、氨基酸序列，构建相关系统发育树并预测蛋白结构。分析结果显示，PpCYP707A4与PpCYP707A5核苷酸序列和氨基酸序列相似度较高，为94.27%和94.96%，两者蛋白理化性质相近，符合家族基因的特点。系统进化树显示，„黄花梨‟的PpCYP707A4和PpCYP707A5与苹果的2个基因（XP_008346457.1、XP_008382035.1）分别单独聚类，而非PpCYP707A4和PpCYP707A5独自聚类。对苹果[14]、大豆[15]、剑兰[16]的研究结果也显示CYP707A家族基因在系统发育树并未单独聚为一类而是分散到几类中。梨基因组数据发表后，Wu等[17]认为蔷薇科的染色体是由祖先7个染色体发展形成的，梨和苹果基因组之间具有高共线性。该研究克隆的2个基因很可能产生于梨和苹果的共同祖先，而后遗传给梨和苹果。CYP707A是一个多基因家族，它们在不同组织中的转录模式不同[2]，以功能交迭的方式参与环境胁迫应答[4，18-19]、休眠解除[20]等不同的生理反应过程，共同调控植物体内源ABA的分解。因而，需进一步研究该基因家族各基因的特性，研究它们的生物学功能，为开展„黄花梨‟花芽休眠的研究提供信息，为短低温梨品种的选育奠定基础。

参考文献

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第四篇：网址一(免费论文毕业论文查找方法)

网址大全一（免费论文、毕业论文查找方法大全）

一、找论文网站

维普中文数据库

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二、直接找特定论文

除了找论文网站，我们也可以直接搜索某个专题的论文。看过论文的都知道，一般的论文，都有一定的格式，除了标题、正文、附录，还需要有论文关键词，论文摘要等。其中，“关键词”和“摘要”是论文的特征词汇。而论文主题，通常会出现在网页标题中。

例：关键词 摘要 intitle:物流

三、通过各种网络电子资源检索

1、文献数据库

国内主要资源

(1)维普：主要是科技论文；

(2)万方：科技引文、学位论文、会议论文等；

(3)cnki：学术期刊，和维普有点点区别；

(4)超星图书馆、书生之家图书馆、中国数字图书馆及全国知名大学图书馆等等。

国外主要资源

(1)SpringerLink：包含学科：化学、计算机科学、经济学、工程学、环境科学、地球科学、法律、生命科学、数学、医学、物理与天文学等11个学科，其中许多为核心期刊；

(2)IEEE／IEE：收录美国电气与电子工程师学会（IEEE）和英国电气工程师学会（IEE）自1988年以来出版的全部150多种期刊，5670余种会议录及1350余种标准的全文信息；

(3)Engineering Village：由美国Engineering Information Inc.出版的工程类电子数据库，其中Ei Compendex数据库是工程人员与相关研究者最佳、最权威的信息来源；

(4)ProQuest：收录了1861年以来全世界1,000多所著名大学理工科160万博、硕士学位论文的摘要及索引，学科覆盖了数学、物理、化学、农业、生物、商业、经济、工程和计算机科学等，是学术研究中十分重要的参考信息源；

(5)EBSCO数据库 ASP（Academic Search Premier）：内容包括覆盖社会科学、人文科学、教育、计算机科学、工程技术、语言学、艺术与文化、医学、种族研究等方面的学术期刊的全文、索引和文摘； BSP（Business Source Premier）：涉及经济、商业、贸易、金融、企业管理、市场及财会等相关领域的学术期刊的全文、索引和文摘；

(6)SCIENCEDIRECT数据库：是荷兰Elsevier Science公司推出的在线全文数据库，该数据库将其出版的1,568种期刊全部数字化。该数据库涵盖了数学、物理、化学、天文学、医学、生命科学、商业及经济管理、计算机科学、工程技术、能源科学、环境科学、材料科学、社会科学等众多学科；

(7)OCLC(OnlineComputerLibraryCenter)即联机计算机图书馆中心，是世界上最大的提供文献信息服务的机构之一.其数据库绝大多数由一些美国的国家机构、联合会、研究院、图书馆和大公司等单位提供。数据库的记录中有文献信息、馆藏信息、索引、名录、全文资料等内容。资料的类型有书籍、连续出版物、报纸、杂志、胶片、计算机软件、音频资料、视频资料、乐谱等。

2、文献检索

(1)国内期刊报纸全文可以在万方，维普，cnki进行检索，其他专业的数据库也可以；学位论文，可以在万方、cnki检索。专利、标准等文献还是要到相应的数据库进行检索；

(2)国外期刊在我以上提供的数据库都可以检索，而学位论文多是在ProQuest数据库进行检索；

(3)进入数据库方法和思路

1)购买权限，这个不用我废话，理论上这些资源部是免费的。查阅时，只能到购买权限的单位，才能进入数据库。或者，如果你有足够的钱的用来烧的话，那你可以购买阅读卡，一切都ok了；

2)采用公共的用户名和密码。这种方法用起来是最好最省事情的，但是搜索可就费时间了。密码来源多是试用形式的，一段时间会过期。取得这种密码，要看你的搜索能力了，有时间我会谈谈搜索经验和大家交流。如果你水平足够高超的话，可以自己研发破解工具，或者使用破解工具进行破解，前一段时间网上超星破解版就是个例子，不过现在很多不能用了；

3)使用高校或者科研单位代理。这种方式挺好，但是对于菜鸟级别的有时就显得有点难以操作了。简单的说，代理服务器的工作机制很象我们生活中常常提及的代理商，假设你的机器为A机，你想获得的数据由B机提供，代理服务器为C机，那么具体的连接过程是这样的。首先，A机需要B机的数据，它与C机建立连接，C机接收到A机的数据请求后，与B机建立连接，下载A机所请求的B机上的数据到本地，再将此数据发送至A机，完成代理任务。所以能获得好的，快速的高校或者科研院所的代理，你就可以通过这个代理在这些地方寻找你的资料了，不会再出现“ip地址不在允许范围内”的提示了。

最后说一下，就国内资源，维普期刊好一些，万方也不差，当在cnki遇到麻烦的时候，可以去万方、维普找你的资料。

3、文献检索工具

大家对网络上的搜索工具一定不陌生吧？百度，google，至于其他的新浪、网易搜索就不必再说，我觉得功能有限。

(1)百度

个人认为百度搜索中文网页能力比较好，而且搜索的很全，便于读者查看。讲正题，我用百度搜学术资源密码也有一些成功的经验。比如说，注意到cnki的很多密码都是cnkikw，于是我们可以键入cnkikw，搜索密码会出来很多相关网页，都是各大论坛，以及其他网站发布或者转载的账号密码，当然一些是过期的，但很多还是可以用的，只要你有时间，同时你还有很多意想不到的收获！虽然下了功夫，但是一旦成功是很有成就感的。各位朋友不妨一试！

除了用百度直接搜索密码以外，我们在网上检索一些中文文献的时候会遇到全文的情况，此时要注意顺着地址栏找下去，往往会找到你要的很多文献全文。例如：我找 “有效氯 检测” 时找到这个网址

(2)google

google的废话也多一些，因为它的功能很强大，尤其对于国外的很多学术资源用它最好。下面我就介绍一下，自己用google搜集文献资料的方法,供大家参考。

1)国外论文搜索

我们注意到，从网上找到的国外论文大部分是pdf格式。所以，细心一点会发现，在google搜索的文献旁边都有一个[pdf]字样，因此我尝试用“key words” +“pdf” 的模式搜索国外文献，效果很好！比如，我查找国外海洋防污涂料的文献,输入 “antifouling pdf ”,结果举例：

[PDF] SEAPRO ANTIFOULING SEAPRO ANTIFOULING M014 [PDF] Biocide-free Antifouling coatings Performance, Prospects and...[PDF] 2002grc093 The Antifouling Performance of Non-Toxic Silicone...等等。。。

就这样，我就找到了很多原版文献。但是这种方法盲目性较大，适合初学者使用，各位也可以试试看。

2)利用google搜密码

最早以前，我曾经用 “ password+journal” 方法搜过一些，效果也很明显。后来有人提出一个号称通吃天下文献数据库的密码万能的公式，password=welcome+(X)，x 可以为任何一个文献数据库的名称，可以写成：

password=welcome+ProQuest password=welcome+Ingenta password=welcome+EBSCO。。。

等等，放到google里后，检索为 “password welcome ProQuest”这样会有好多的密码出现，你慢慢尝试吧！据说这个方法是一个叫 Hmongbook 的人概括出来的，真感谢他！我个人使用后感觉不错！另外，并不是所有的数据库登陆都是username password,比如我前几天查找的英国economist周刊，他的检索关键词就应该为： “password e-mail ”,这需要各位的细心了！

上述一种常用方法，现在也提供一下个人以及网友提供的检索常用搜索词的一些例子，模式上基本大同小异。

medicine journal ID pw PASSWORD Virtuelle Bibliothek PASSWORD “Online Full Text Resources password” “health sciences library password ” “OvidLWW password” “medizin bibliothek password” “medizin Volltext password” “medizin literatur password” “health ejournals password ” “medizin elektronik password” medicina BIBLIOTECA password médecine PéRIODIQUES éLECTRONIQUES password

health ejournals password American Journal of Medicine OnLine FULL TEXT Journals username password medicine journal fulltext username 同时，如果你足够细心，你会在这样的检索中有很多以外的收获。国外有很多密码页，上面公布很多期刊数据库的密码和登陆方式。

3)如何用GOOGLE快速查找图书馆试用资源

其实在论坛里公布的cnki/vip/wanfang/renda/ssreader等入口或密码，往往是各高校图书馆免费试用的资源。这里我介绍给大家如何用GOOGLE快速查找图书馆试用资源。在GOOGLE的搜索栏里输入：“intitle:试用数据库 inurl:lib” 便可以快速找到各高校图书馆的免费资源了。这些密码虽然持久不了，但是足够解燃眉之急。这是一个密码页。你可以保存起来，说不定今后你会用到他们。

用google查密码or密码页（flash介绍）--4)利用google突破图书馆入口IP限制小技巧

利用google的强大的检索功能我们还可以这样快速突破图书馆的入口.在GOOGLE里试试这个：“index of/ ” inurl:lib 输入：“index of /” cnki，可以找到许多图书馆的CNKI、VIP、超星，还有其他国外资源的入口，不过要花一些耐心。

这里想说明一点，百度查找中文的期刊还是很管用，因为百度中文页面更新很快，而GOOGLE在中文方面就不是很在行了，但是英文网页，GOOGLE则是一个星期更新一次，频率较快，优先采用检索国外数据！但是GOOGLE有些朋友不是很喜欢用，原因在于进入页面以后不容易查找关键词，这里我推荐几个可以看到GOOGLE快照的网站，朋友们今后可以用这些网站进行GOOGLE的搜索，很方便，容易看到关键词，不仅有利于文献的查找.还适合其他检索！

第五篇：资料查找 方法总结

资料查询 方法总结

1.IP反查：站长工具（IP查询）2.ICP备案：-公司-（苏）ICP备；

扬州有限公司-ICP-时间；

3.Copy Right-时间（2011）-扬州/江苏扬州；

GB2312（英文翻译）；

4.工商查询：例 扬州工商-工商公告（最新市重守企业 最新市驰名商标企业 最新市著名商标企业 最新市诚信单位 最新市新设企业）

可姓名反查

5.**-公司-inurl:cn/com/net 0514 6.百度地图:（按地区 公司名称查询）然后反查； 7.搜狗地图：输入**公司（查看周边有关公司）8.企查查：关键词；

传众：关键词（地址/行业）；

9.反查其他网络公司做的网站：扬州限公司-技术支持-网络公司名称 10.Made in china：名录-反查 11.APP：寻客/云客 12.百度 手机号码反查 13.政府网站：例 环保局

14.招聘网站：58同城等 关键词（招销售 机械工 高薪技术企业 等）15.微信：添加朋友-关键词（如 扬州机械公司）16.平台：例 中国供应商（找公司名称）-反查 17.代码查询（找丑网站的共同点）